Рассмотрим более внимательно структуру конкурсного белка T0691:

Обратите внимание на расположение радикалов триптофана (квадратный 3х3) и тирозина (бензольное кольцо с группой OH) на переднем плане.

На заднем плане за радикалом триптофана тоже виден какой-то радикал. Всё это напоминает типовую структуру активного центра с резонансной системой.

Материал с форума лаборатории Наномир: 

diprospan: да, и подтверждается тем, что совпадает дипольный момент:

Кушелев: Вы не могли бы дать более развёрнутый комментарий? Что за момент, с чем совпадает, откуда это видно? 

В белке T0692 тоже обнаружился любопытный фрагмент, характерный для активных центров белка... 

 Наличие цикличного участка белка T0694, вероятно, можно проверить экспериментально. 

Кушелев: И что с чем совпадает? 

diprospan: активный центр белка пожалуй лучшее ваше определение в этом векторе.

Кушелев: Вы хотите сказать, что активный центр попадает в зону максимальной напряжённости электрического поля? Такое совпадение действительно вряд ли случайно...

Поле ориентирует некую полярную молекулу, после чего её обрабатывают на триптофановой наковальне в резонансном (?) режиме

Вторичная структура фактически замыкается. Изображение получено в браузере Avogadro

Любопытная структура белка T0697. Возможно, что спираль гнется на пролинах и образует некий реберный многогранник... 

T0692, Trp467

Кушелев: Согласитесь, что таких совпадений не бывает... 

Источник

*

*

Правый столбец 2D Диаграммы Пикотех - нотная запись процесса сборки белковой молекулы

*

Ра

Сотовая четвертичная структура белка OLQ02947

раскрывает тайны цитоскелета 

 Symbiodinium microadriaticum.

Вот, что известно о белке, в состав которого входит эта гиперспираль: https://www.uniprot.org/uniprot/Q54KA7

Цитата: Protein: Ankyrin repeat Molecular function: guanyl-nucleotide exchange factor activity

Цитата2: actin cytoskeleton organization 

Кушелев: Автоперевод на русский: организация актинового цитоскелета

Ну что же, неплохо для начала. Цитоскелет из трёхгранных призм очень функционален. Теперь слово за структурными биологами, которые знают о структуре этого белка из "мокрых экспериментов". 

В реальном белке три слоя, причём состоящих из более тонких слоёв. Первый слой состоит из 4 более тонких. Далее происходит смещение. Под альфа-спиралями (красный) оказываются пи-спирали (голубой). Этот второй слой в свою очередь состоит из 7 более тонких. Далее происходит второе смещение. Под пи-спиралями второго слоя (голубой) оказываются 310-спирали (оранжевый). Этот третий слой состоит из трёх более тонких. В итоге каждая грань каждой треугольной призмы состоит из спиралей трёх типов. Это значит, что параметры граней являются усреднёнными параметрами трёх типов спиралей. Это обусловливает высокую стабильность геометрии. Чем-то напоминает свойство пчелиных сот. Видимо, это очень важно для цитоскелета (скелета клетки) Symbiodinium microadriaticum.

*

*Посмотреть примеры пяти полных 2D Диаграмм Пикотех

Вторичная структура белка начинается с программной 35-спирали длиной 8 аминокислотных остатков. 8-ой остаток Ser является последним остатком программной 35-спирали и первым остатком пи-спирали, которая состоит из 4-х аминокислотных остатков. Далее идёт последовательность композиционных кодов 5233553, а за ней один виток альфа-спирали: 1111, образованный аминокислотными остатками LQST. Остатки SIP под номерами 38,39,40 образуют виток бета-спирали. Затем последовательность EEMKQI образует примерно половину витка программной 35-спирали. Остатки с 81 по 86 образуют гибридную альфа-310-спираль. Далее 87-90 идет пи-спираль. 94-98 - 310-спираль (полтора витка). 120-123 - один виток альфа-спирали. Участок 124-334 структурирован одиночными композиционными кодами всех типов. 335-341 - программная 355-спираль. 342-346 - программная 23-спираль. 346-351 - пи-спираль (примерно полтора витка). 360-363 - один виток 310-альфа-спирали. 378-383 - прямая альфа-спираль (полтора витка). 414-418 - альфа-310-спираль (примерно 1.3 витка). 431-435 - программная 23-спираль. 440-443 - гнутая метионином альфа-спираль (примерно 1.2 витка). 467-471 пи-спираль (примерно 1.2 витка). 469-480 - программная 3335-спираль.

147-173 - наиболее протяженный участок альфа-310-спирали.  Весь белок представлен преимущественно участками альфа-310-спиралей.

*

*

В открытом и закрытом состоянии

*

Примеры программных спиралей

В этом фрагменте белка присутствуют две программных спирали.

Программная 1111223553355532114135322332-спираль. Период 28 аминокислотных остатков.

Программная 111135332332-спираль. Период 12 аминокислотных остатков.

*

*

Высоко периодичные структуры белков

РСА: что мы видим?

Пикотехнологические программные спирали белка

Модель коллагена (программная 335-спираль) -  яркая демонстрация несовершенства рентгеноструктурного анализа. Специалисты по РСА конструируют спираль коллагена из того, что им известно. А известна им альфа-спираль. Вот они и сконструировали модель из 3 альфа-спиралей. Программа Пикотех показывает, что это не тройная, а одинарная, но программная 335-спираль. Радикалы аминокислот действительно располагаются в виде трёх-заходной спирали, что и сбило с толку специалистов по РСА.

Другие программные спирали специалисты по РСА тоже ошибочно интерпретируют известными им "базовыми спиралями", но настало время показать, как устроены реальные, программные спирали белков.

Другими яркими примерами, демонстрирующими несостоятельность РСА, являются  сверхдлинные, в том числе программные спирали.

Наконец, Пикотехнология в отличие от РСА имеет возможность самоповерки. В частности, самоповеркой является 100%-ная корреляция между первичной и вторичной структурой некоторых белков, например, сверхдлинных программных спиралей. Спирали длиной более 1000 витков исключают случайные совпадения, согласитесь. Например, вероятность случайного совпадения композиционных кодов для 310-спирали длиной более 3982 аминокислотных остатков не превышает 4^-3982=2.5*10^-2397, т.е. более двух тысяч нулей после запятой.    

*

*

2017.10.29 20:37:14

Что такое программа "Пикотехнология белков", и как её грамотно использовать

Пикотехнология помогла найти ошибки рентгеноструктурного анализа

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/937513727#

>ENA|ALI34365|complement 1830 nucleotides
ttgagtcttacagaaaaatgtgatatttatgcagctcttcatgatgcaggaattaataga
gtggttaaacatcttatgcaacagcgcccgtctctttttaattttggtacttccttttta
gcatcaaatccaaatctattgtgtgaaaaaattatagctgtgcaagaagtaaacagacaa
cagaatcctcttttaacaatactagaaccaattcctgtcattggtctaccattaagccaa
tctagttcaaacaatttggcaataaattttgcaattcaactttctaaagctgaaatagat
ttccatgaagggaatgtatttcctttaccttcagaacttgtcccattggcaaatcaacgt
ttggctactcatttcaaagtttgtgccggcttggattgtctcggggacttgcctgttctt
agaaggcctccaaataccagaccgtctacttccaaactagaatgtttttgtctagatttg
tatgctataggtggatgcaaaatctctggattagcagaaaaccaaaaaatagggctcaaa
attgatgggatagagatagtggatttaaaaccccaaggattggaaaatgcaatcgaatgt
tatgcaaaatctgtacttaatcatggaatttttccccatgttgctgagattatttccaaa
ttgacatttgggataattactattcctccatccaatggtaacttccaagtatcaggaaat
ttgcagctttcaggaactacgaccgttcctagtaatcctgcaatcgaagatgatcaatta
aaaacatttatcaatttagacaatttggacttggatatcgtattctcaccaaatggtggc
ggtagtggcggtagtggcggtagtggcggcagtggcggcagtggcggtagtggcggcagt
ggaacaataacaagaacagtgaggccgcgatcaagaacaggcacctttgatctaaccgct
gctatatccgaaactacatttaaaaaaatatatggtgcccttcttgaaggatttaaattt
tcagtatcagacacgggcggctctggtatattctcagtaggttatacagtttcggctcat
ttagagaatggcacaatcgatctgcggaataatggttctattctaataagtgaattagac
gtgaaatgggacacattgcagcttaacataggcatagatattccaacacaaactattggt
ggcttttgcctcgttccaaatccatttggtggatgtttgattcgtgctccgtcaattgat
ctttttgaagcatcacctgatatttctttacccttgaacttgggtggactaataacatct
gaaattactttgagtgtaattccaaaggtgttttatggagttggctctggaattccaaac
agatggcaacttaccttagtccctacgcttccaatcgacttggatataattgacgtagca
gacacaattggagatttatttcataatctgattacaaatgcaattgtcagtcttcttagt
tctttgggactccctgattgggctatatcttttatagataccgtgcttggtggaatagaa
ggaataatccgaaacattctagatattggagacgatgtgggtgaatttattttaagtttg
attagtaatgttggtctattccaggatttgattgataagctggctcaattcatagcgctt
acgattctggaactcaaggatcccttggaagttcttgagggaaattctgccataccttta
attccagtaaagttaccaattgaatttttggatgttcggatcgatggtaatggtaatgag
ttgatccttgaaggggatgtgggtaattag

Результат:

Развёрнуто: https://img-fotki.yandex.ru/get/97884/1 … 0_orig.png

В исследуемом белке обнаружен переход программной 335-спирали, характерной для коллагена первого типа в программную 553-спираль, которые строятся под музыку с размером 3/8 (в темпе вальса, точнее в темпе коллагена). Далее программная спираль переходит в бета-спираль длиной 4 аминокислотных остатка.

Кушелев: Модель коллагена (программная 335-спираль) очень яркая демонстрация несовершенства рентгеноструктурного анализа. Специалисты по РСА конструируют спираль коллагена из того, что им известно. А известна им альфа-спираль. Вот они и сконструировали модель из 3 альфа-спиралей. Программа Пикотех показывает, что это не тройная, а одинарная, но программная 335-спираль. Радикалы аминокислот действительно располагаются в виде трёх-заходной спирали, что и сбило с толку специалистов по РСА.

Другие программные спирали специалисты по РСА тоже ошибочно интерпретируют известными им "базовыми спиралями", но настало время показать, как устроены реальные, программные спирали белков. Некоторые из них имеют очень необычные параметры. Такова, например, программная 35-спираль:

Другими яркими примерами, демонстрирующими несостоятельность РСА, являются сверхдлинные в т.ч. программные спирали/

Наконец, Пикотехнология в отличие от РСА имеет возможность самоповерки. В частности, самоповеркой является 100%-ная корреляция между первичной и вторичной структурой некоторых белков, например, сверхдлинных программных спиралей. Спирали длиной более 1000 витков исключают случайные совпадения, согласитесь. Например, вероятность случайного совпадения композиционных кодов для 310-спирали длиной более 3982 аминокислотных остатков не превышает 4^-3982=2.5*10^-2397, т.е. более двух тысяч нулей после запятой  

2016.12.25 00:09:02

Victoriy пишет:

где РСА о том, что на участке из 17 а.о. в АПФ (белок от diprospan) действительно 3/10 спираль

Кушелев: А тут дело уже не в РСА, а в ничтожной вероятности повторения одинаковых кодов "4", "1", "3" и "2".

Если бы коды "1" и "4" были бы равнозначными, то почему встречаются длинные последовательности 1111111111 и 444444444444 ? По-Вашей гипотезе это бессмысленно.

По моей это прямые альфа- и 310-спирали соответственно.

2016.12.25 00:44:57

Кушелев: Вероятность случайного расположения 17 одинаковых кодов = 0.25^-17 = 5.8*10^-11

Вероятность случайного расположения 22 звеньев цикла = 0.25^-22 = 5.7*10^-14

Вероятность случайного расположения 22 одинаковых кодов = 0.25^-22 = 5.7*10^-14

2016.12.25 02:12:41

http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore … ureId=4BT9

http://www.uniprot.org/uniprot/P13674

http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/AAA36534

http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/AAA3 … play=fasta

>ENA|AAA36534|AAA36534.1 Homo sapiens (human) hypothetical protein 
ATGATCTGGTATATATTAATTATAGGAATTCTGCTTCCCCAGTCTTTGGCTCATCCAGGC
TTTTTTACTTCAATTGGTCAGATGACTGATTTGATCCATACTGAGAAAGATCTGGTGACT
TCTCTGAAAGATTATATTAAGGCAGAAGAGGACAAGTTAGAACAAATAAAAAAATGGGCA
GAGAAGTTAGATCGGCTAACTAGTACAGCGACAAAAGATCCAGAAGGATTTGTTGGGCAT
CCAGTAAATGCATTCAAATTAATGAAACGTCTGAATACTGAGTGGAGTGAGTTGGAGAAT
CTGGTCCTTAAGGATATGTCAGATGGCTTTATCTCTAACCTAACCATTCAGAGACCAGTA
CTTTCTAATGATGAAGATCAGGTTGGGGCAGCCAAAGCTCTGTTACGTCTCCAGGATACC
TACAATTTGGATACAGATACCATCTCAAAGGGTAATCTTCCAGGAGTGAAACACAAATCT
TTTCTAACGGCTGAGGACTGCTTTGAGTTGGGCAAAGTGGCCTATACAGAAGCAGATTAT
TACCATACGGAACTGTGGATGGAACAAGCCCTAAGGCAACTGGATGAAGGCGAGATTTCT
ACCATAGATAAAGTCTCTGTTCTAGATTATTTGAGCTATGCGGTATATCAGCAGGGAGAC
CTGGATAAGGCACTTTTGCTCACAAAGAAGCTTCTTGAACTAGATCCTGAACATCAGAGA
GCTAATGGTAACTTAAAATATTTTGAGTATATAATGGCTAAAGAAAAAGATGTCAATAAG
TCTGCTTCAGATGACCAATCTGATCAGAAAACTACACCAAAGAAAAAAGGGGTTGCTGTG
GATTACCTGCCAGAGAGACAGAAGTACGAAATGCTGTGCCGTGGGGAGGGTATCAAAATG
ACCCCTCGGAGACAGAAAAAACTCTTTTGCCGCTACCATGATGGAAACCGTAATCCTAAA
TTTATTCTGGCTCCAGCTAAACAGGAGGATGAATGGGACAAGCCTCGTATTATTCGCTTC
CATGATATTATTTCTGATGCAGAAATTGAAATCGTCAAAGACCTAGCAAAACCAAGGCTG
AGCCGAGCTACAGTACATGACCCTGAGACTGGAAAATTGACCACAGCACAGTACAGAGTA
TCTAAGAGTGCCTGGCTCTCTGGCTATGAAAATCCTGTGGTGTCTCGAATTAATATGAGA
ATACAAGATCTAACAGGACTAGATGTTTCCACAGCAGAGGAATTACAGGTAGCAAATTAT
GGAGTTGGAGGACAGTATGAACCCCATTTTGACTTTGCACGGAAAGATGAGCCAGATGCT
TTCAAAGAGCTGGGGACAGGAAATAGAATTGCTACATGGCTGTTTTATATGAGTGATGTG
TCTGCAGGAGGAGCCACTGTTTTTCCTGAAGTTGGAGCTAGTGTTTGGCCCAAAAAAGGA
ACTGCTGTTTTCTGGTATAATCTGTTTGCCAGTGGAGAAGGAGATTATAGTACACGGCAT
GCAGCCTGTCCAGTGCTAGTTGGCAACAAATGGGTATCCAATAAATGGCTCCATGAACGT
GGACAAGAATTTCGAAGACCTTGTACGTTGTCAGAATTGGAATGA

Много обещающая альфа-спираль с 21 по 71!!!

А что нам покажет программа Пикотех?

https://img-fotki.yandex.ru/get/194503/ … 6_orig.gif

Такова однако точность РСА...

Эта периодическая структура может оказаться ...  научным прорывом. Но это мы проверим уже завтра...

2016.12.25 13:44:41

Victoriy пишет:

Похоже я открыла ящик Пандоры, научив А.Ю. пользоваться PDB . 
Уважаемый Александр Юрьевич, давайте вместе проанализируем Ваш материал по кодированию различных видов спиралей на основе экспериментально показанных спиральных участков в белках 1TAG; 3SDH; 1GPB; 1PZ4; 1OBO; 1GS6; 1H1N; 1LRV и АПФ от Дипроспана. Структура последнего энзима мне лично не безразлично, т.к. его активность в сыворотке крови пациентов с лакунарными инсультами я определяла в этом году в одной из текущих НИР.
Предлагаю в скайпе голосом, а потом Вы выложите свой материал на форуме.

На форум интересно текст выложить, а не голос  Давайте сначала разберёмся с самоповеркой пикотехнологии

Согласитесь, что таких случайностей просто не бывает 

Кстати, эта тема имеет продолжение

Итак, вопрос для богини пикотехнологии, Виктории Соколик:

"Вы согласны, что структуры альфа-спирали, 310-спирали, фрагмента лизоцима из этой темы однозначно подтверждают:

1. Кодирование прямой альфа-спирали кодами -1111111111111111111111-
2. Кодирование прямой 310-спирали кодами -444444444444-
3. Программирование цикла из 22 аминокислотных остатков лизоцима" ?

Если есть возражения, то жду Ваших аргументов. Пока мы не придём к консенсусу по данному вопросу, более сложные вопросы, как то нюансы статистики, я обсуждать не готов.

2016.12.25 13:50:02

http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore … ureId=5KYN

http://www.uniprot.org/uniprot/Q15436

http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/CAA65774

https://img-fotki.yandex.ru/get/50623/1 … 8_orig.gif

Как видим, данные РСА опять не соответствуют даже типу белка. Указаны десятки протяженных альфа-спиралей, а в структуре белка их нет 

Очень любопытный тип программной спирали

[21:56:06] Кушелев Александр Юрьевич: Я сейчас пишу о прямой альфа-спирали, состоящей из 22 аминокислотных остатков
[21:56:21] Кушелев Александр Юрьевич:

[21:58:49] Кушелев Александр Юрьевич: Вероятность случайного образования прямой альфа-спирали из 22 ао = как 44 раза монетка упадёт на "орла"
[21:59:14] Кушелев Александр Юрьевич: Если Вы думаете, что это вероятно, попробуйте 

2016.12.25 22:25:26

Skype:

[28.11.2016 20:25:50] *** Кушелев Александр Юрьевич отправил контактные данные каштан. ***
[16:42:43] каштан: у вас на этой картинке

что изображено ?
[17:36:39] Кушелев Александр Юрьевич: Кольцегранная и упрощённая (многогранная) динамическая модель аминокислоты
[17:37:48] каштан: пять атомов ?
[17:37:51] Кушелев Александр Юрьевич: Да. Это глицин
[17:38:10] каштан: какие пять атомов ?
[17:40:57] каштан: https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%93%D0 … 0%B8%D0%BD
здесь написано про шесть атомов
[17:41:02] Кушелев Александр Юрьевич: NCCOO
[17:41:09] Кушелев Александр Юрьевич: Да, это они
[17:42:00] каштан: глицин это NHHHOO
вы что-то другое написали
[17:42:33] Кушелев Александр Юрьевич: Водород не показан
[17:42:45] Кушелев Александр Юрьевич: Только атомы углерода, азота и кислорода
[17:43:01] Кушелев Александр Юрьевич: NCCOO
[17:44:45] каштан: почему атомы одинаковых размеров ?
[17:45:43] Кушелев Александр Юрьевич: Потому что разных
[17:45:47] Кушелев Александр Юрьевич: 
[17:47:19] каштан: на этой картинке атомы под другому соединяются

[17:48:39] Кушелев Александр Юрьевич: Одни и те же атомы углерода могут соединиться в алмаз и графит
[17:49:06] каштан: в смысле вкладываются друг в друга
[17:50:35] Кушелев Александр Юрьевич: Нет
[17:50:50] каштан: кислород в полтора раза больше углерода - на вашей картинке этого не видно
[17:52:16] Кушелев Александр Юрьевич: Углерод может иметь разный размер в зависимости от условий. Он может быть многогранным и сопряжённым
[17:55:02] каштан: вы говорите о группе атомов
сами атомы одного элемента одинаковые с незначительными отличиями по изотопам
ещё раз
атом углерода в полтора раза меньше атома кислорода
[17:55:29] каштан: соколик вам об этом говорила
[17:55:37] Кушелев Александр Юрьевич: Один и тот же атом углерода может иметь разные размеры и форму
[18:04:37] каштан: ATG - это метионин ?
https://en.wikipedia.org/wiki/Methionine
в состав которого входит сера ?
[18:05:27] Кушелев Александр Юрьевич: Да
[18:05:57] каштан: атом серы в три раза больше атома углерода
[18:06:30] каштан: и в два раза больше кислорода с азотом
[18:06:42] Кушелев Александр Юрьевич: И так бывает
[18:07:03] каштан: в вашей модели все атомы одинаковые ?
[18:07:57] Кушелев Александр Юрьевич: Нет. Даже один атом углерода может иметь сильно разные размеры. Я уже писал выше
[18:09:23] каштан: атом углерода может иметь размеры атома серы и в результате программа строит модель из атомов одинаковых размеров ?
[18:13:12] Кушелев Александр Юрьевич: Какие же это одинаковые размеры?

[18:14:11] Кушелев Александр Юрьевич:

[18:15:25] Кушелев Александр Юрьевич: Зеленые и красные могут быть атомами углерода (+водород)
[18:20:45] каштан: в этой модели

все атомы выглядят одинаковыми
соколик говорила о том что ваша программа не учитывает межатомные расстояния (размеры атомов)
найти это сообщение не представляется возможным потому что у вас на форуме нет поиска
[18:22:08] Кушелев Александр Юрьевич: Во-первых, на форуме поиск есть, но для зарегистрированных пользователей.
[18:22:34] Кушелев Александр Юрьевич: Во-вторых, я Вам уже показал, что даже один атом углерода может иметь разные размеры. Причём сильно разные.
[18:24:36] Кушелев Александр Юрьевич: Виктория говорит о том, что в моей программе не учтены изменения радиусов внешних электронов. Это действительно так. Но радиусы колец-электронов, например, для ионов кислорода, хлора и фтора отличаются меньше, чем на процент. У Виктории размеры электронов/граней отличаются на порядок больше, т.е. ошибочно. Поэтому моя программа хоть и упрощённая, но раз в 10 точнее 
[18:27:51] Кушелев Александр Юрьевич: Но это только по радиусам электронов. Если говорить о вторичной структуре, то тут уже различие в точности принципиальное. Ведь у Виктории по кодам "1" и "4" строится прямая спираль с шагом 3 аминокислотных остатка на виток. А большинство спиральных участков имеет 3.6 аминокислотных остатка на виток. При этом фазовый набег приводит к тому, что спиральные участки у Виктории повёрнуты не на те углы, поэтому все модели белков "в раскоряку" 

Victoriy пишет:

Виктория слегка подпортила таблицу;

Кушелев: Тут два варианта. Либо Виктория слегка подпортила таблицу, либо Виктория легко кинет монетку на "орла" 44 раза подряд 

Victoriy пишет:

У Виктории размеры электронов/граней отличаются на порядок больше, т.е. ошибочно.

Кушелев: Сначала я определил радиусы кольцевых электронов из рефрактометрических радиусов ионов кислорода, хлора и фтора (Работа Гольдшмидта 1923г). Для ионов кислорода, хлора и фтора отличие радиусов электронов не превышало 1%. Позднее радиусы электронов удалось уточнить масштабированием белковых молекул. Ведь макромолекулы белка могут иметь гигантские размеры в масштабах микромира. Я подобрал размер кольцевого электрона таким образом, чтобы размеры белковых молекул, определённых экспериментально совпали с кольцегранными моделями в программе PiMol и HyperChem.
Совпадение размеров макромолекул получилось при диаметре кольца-электрона 1.7А.

Действительно, атом серы в том же метионине 

или цистеине существенно больше атома углерода, там внешние электроны раздвинуты предвнешней оболочкой, но это - радикал, который не влияет на параметры белковой "цепи". Ведь параметры белковой "цепи" определяются геометрией пептидной группы. Согласны?

*

*

2017.01.15 13:35:14

http://www.myshared.ru/slide/643151/

Цитата: 15  МЕТИОНИН - незаменимая АМК. Необходима для синтеза белков, участвует в реакциях дезаминирования, является источником серы для синтеза цистеина. Метионил-тРНК участвует в инициации трансляции. Метильная группа метионина - мобильный одноуглеродный фрагмент, используемый для синтеза ряда соединений в реакциях переноса этой группы на соответствующий акцептор (реакция транс- метилирования) Метильная группа в молекуле метионина прочно связана с атомом S, поэтому непосредственным донором этого одноуглеродного фрагмента служит активная форма метионина - S-аденозилметионин (SAM) 
16  S-аденозилметионин (SAM) - сульфониевая форма метионина, образующаяся при его присоединении к молекуле аденозина (продукта гидролиза АТФ) Реакция активации метионина Присутствует во всех типах клеток Структура (S + -CH 3 ) в SAM - нестабильная группировка, определяющая высокую активность метильной группы (отсюда термин «активный метионин»). Это уникальная реакция, единственная, в результате которой освобождаются все три фосфатных остатка АТФ. Отщепление метильной группы от SAM и перенос ее на соединение -акцептор катализируют метилтрансферазы в реакциях транс- метилирования. SAM в ходе реакции превращается в S-аденозилгомоцистеин (SAГ). 
Конец цитаты.

Кушелев: Понятно. Связь Met-Cys косвенно подтверждается, т.к. Cys образуется из Met, а значит, что в мышином лизоциме тоже возможно превращение Met в Cys в процессе дозревания белка.

>NM_207361.5 Homo sapiens FRAS1 related extracellular matrix protein 2 (FREM2), mRNA
GGGATTTCCCTCAAAGCCCAGGGTCCGGGGACCTGGAAAGTAGAAGTGGAGGGATTCAATTCTCCGCGCG
ATTGAGGCGCTAGCGGCGGAGCTGGACGGCCTGGGAAGGCTTCGGCTCCTCGGCTGCGGCTCCAGCCCGG
ACGGCGCCGCGCAACTTTGCCATCCTTCTGGCCCAGCCCCGGCTACAGGAGGACCCCGCGGGCAACGCGC
GGAGTTCCTGGCACTTCCCGGCGGTGTCTCTTGTTGTCTGCCCGGGGACCGACTTCGCATGCTCTCAGGC
TGACCTGTCCAAGCCCGAACACCGGGACCATGCACTCAGCCGGGACTCCCGGGTTATCCTCGCGCCGGAC
AGGCAACTCCACCAGCTTTCAACCAGGACCGCCACCGCCGCCCCGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTTCTC
CTGTCACTGGTAAGCCGCGTCCCGGCACAGCCCGCTGCCTTCGGCAGGGCGTTGCTGTCCCCTGGTCTCG
CGGGGGCTGCAGGGGTCCCTGCTGAGGAGGCCATAGTGCTGGCGAACCGCGGACTCCGGGTGCCTTTCGG
CCGTGAAGTCTGGCTGGATCCCCTGCATGACCTGGTGTTGCAGGTGCAGCCCGGGGACCGCTGCGCGGTT
TCGGTACTAGACAACGACGCACTGGCCCAGCGACCGGGCCGCCTGAGTCCCAAGCGCTTCCCGTGCGACT
TTGGCCCTGGCGAGGTGCGCTACTCTCACCTGGGCGCGCGCAGCCCGTCTCGGGACCGCGTCCGGCTGCA
GCTGCGCTATGACGCGCCCGGAGGGGCAGTAGTGCTACCACTGGTACTGGAGGTGGAGGTGGTCTTCACC
CAGCTGGAGGTTGTGACTCGGAACTTGCCTCTGGTCGTGGAAGAGCTGCTGGGGACCAGCAATGCCCTGG
ACGCGCGGAGCCTGGAGTTCGCCTTCCAGCCCGAGACAGAGGAGTGCCGCGTGGGCATCCTGTCCGGCTT
GGGCGCGCTGCCTCGCTATGGAGAACTCCTCCACTACCCGCAGGTCCCTGGAGGAGCCAGAGAGGGAGGC
GCCCCGGAGACTCTCCTGATGGACTGCAAAGCTTTCCAGGAACTAGGCGTGCGCTATCGCCACACAGCCG
CCAGTCGCTCACCAAACAGGGACTGGATACCCATGGTGGTGGAGCTGCGTTCACGAGGGGCTCCTGTGGG
CAGCCCTGCTTTGAAACGCGAGCACTTCCAGGTTCTGGTGAGGATCCGAGGAGGGGCCGAGAACACTGCA
CCCAAGCCCAGTTTCGTGGCCATGATGATGATGGAGGTGGACCAGTTTGTACTGACGGCCCTGACCCCAG
ACATGCTGGCAGCCGAGGATGCTGAGTCTCCCTCTGACCTGTTGATCTTCAACCTTACTTCTCCATTCCA
GCCTGGCCAGGGCTACTTGGTGAGCACCGATGATCGCAGCCTGCCCCTTTCCTCCTTCACTCAGAGGGAT
CTGCGGCTCCTGAAGATTGCCTACCAGCCCCCTTCTGAAGACTCTGACCAGGAGCGCCTCTTTGAACTGG
AATTGGAGGTAGTGGATCTAGAAGGAGCAGCTTCAGACCCTTTTGCCTTCATGGTAGTGGTGAAGCCCAT
GAACACAATGGCTCCGGTGGTCACCCGGAATACCGGTCTTATTCTCTATGAGGGTCAGTCTCGGCCCCTC
ACAGGCCCTGCAGGCAGTGGTCCGCAAAACTTGGTCATCAGCGATGAGGATGACCTAGAAGCAGTGCGGC
TAGAGGTGGTGGCTGGGCTCCGGCATGGTCACCTTGTCATTCTGGGTGCTTCCAGTGGCAGCTCTGCTCC
CAAGAGCTTTACAGTGGCTGAGCTGGCAGCCGGCCAGGTGGTCTACCAGCATGATGACAGAGACGGCTCG
CTGAGCGACAACCTGGTGCTTCGCATGGTGGATGGAGGAGGCAGGCACCAGGTACAGTTTCTGTTCCCCA
TCACCTTAGTGCCTGTGGATGACCAGCCACCTGTTCTCAATGCCAACACGGGGCTGACACTGGCAGAGGG
TGAAACAGTGCCCATCCTGCCCCTTTCCCTGAGTGCAACTGACATGGATTCAGATGATTCTCTGCTGCTT
TTTGTGCTGGAGTCACCCTTCTTAACTACGGGGCATCTGCTTCTCCGCCAAACTCACCCTCCCCATGAGA
AGCAGGAACTTCTCAGAGGCCTTTGGAGGAAGGAGGGGGCATTTTATGAGCGAACAGTGACAGAGTGGCA
GCAGCAGGACATAACAGAGGGCAGGCTGTTCTATAGACACTCTGGGCCCCATAGTCCTGGGCCAGTCACA
GACCAGTTCACATTTAGAGTCCAGGATAACCATGACCCTCCTAATCAGTCCGGGCTACAGCGGTTTGTGA
TTCGTATCCATCCTGTGGATCGCCTCCCTCCGGAGCTGGGCAGTGGCTGTCCCCTTCGTATGGTGGTACA
GGAATCCCAGCTCACACCACTGAGGAAGAAGTGGCTGCGCTACACTGACCTGGACACAGATGACCGAGAA
CTACGTTACACAGTGACTCAGCCCCCCACAGACACAGACGAAAATCACCTGCCAGCCCCACTGGGTACCT
TGGTCTTGACTGACAACCCCTCAGTCGTGGTGACCCATTTTACCCAAGCCCAGATCAACCATCATAAAAT
TGCTTACAGACCCCCGGGTCAAGAACTGGGCGTGGCTACTCGAGTGGCCCAGTTCCAGTTCCAGGTGGAA
GACCGAGCTGGGAATGTGGCTCCAGGTACCTTTACCCTTTACTTGCATCCCGTGGACAACCAGCCACCTG
AGATCCTCAACACCGGCTTCACTATTCAGGAGAAGGGTCACCACATCCTGAGTGAGACAGAGTTGCACGT
GAATGATGTAGACACTGATGTTGCCCATATCTCTTTCACTCTCACTCAGGCACCCAAACATGGCCACATG
AGAGTGTCTGGACAGATCCTGCATGTAGGGGGTCTCTTCCACTTGGAGGACATAAAACAGGGCCGAGTTT
CCTATGCCCATAATGGGGACAAGTCCCTGACTGATAGCTGCTCCTTGGAAGTCAGTGACAGACATCATGT
GGTGCCCATCACTCTCAGAGTAAATGTCCGGCCAGTGGATGATGAAGTGCCCATACTGAGCCATCCTACT
GGCACTCTGGAGTCCTATCTAGATGTCTTAGAAAATGGGGCTACTGAAATCACTGCCAATGTTATTAAGG
GGACCAATGAGGAAACTGATGACTTGATGTTGACTTTCCTCTTGGAAGATCCACCTTTGTATGGGGAAAT
CTTGGTCAATGGCATTCCAGCAGAGCAGTTTACTCAAAGGGACATCTTGGAGGGCTCTGTTGTATATACC
CACACCAGTGGTGAGATAGGCCTATTGCCTAAAGCGGATTCTTTTAACCTGAGTCTGTCAGATATGTCTC
AAGAATGGAGAATTGGTGGCAATACTATCCAAGGAGTTACTATATGGGTGACCATCCTGCCTGTTGATAG
CCAGGCCCCAGAAATCTTTGTAGGTGAACAGTTGATAGTAATGGAAGGTGATAAAAGTGTTATAACATCA
GTGCATATAAGTGCTGAAGATGTCGACTCCCTGAATGATGACATCTTGTGCACTATAGTTATTCAGCCTA
CTTCAGGTTATGTTGAAAACATTTCTCCAGCACCAGGCTCTGAGAAATCAAGAGCAGGGATTGCCATAAG
TGCTTTCAACTTGAAAGATCTCAGGCAGGGCCACATAAACTATGTCCAGAGTGTCCATAAAGGGGTGGAA
CCTGTGGAGGACCGATTTGTATTTCGTTGTTCTGATGGCATTAACTTTTCAGAGAGACAGTTCTTCCCCA
TTGTAATCATTCCCACCAATGATGAACAGCCAGAGATGTTTATGAGAGAATTTATGGTGATGGAAGGCAT
GAGTCTGGTAATTGATACACCCATTCTCAATGCTGCTGATGCTGATGTTCCCCTGGATGATTTAACTTTC
ACTATTACCCAATTCCCCACTCATGGTCACATCATGAATCAGCTGATAAATGGCACGGTTTTGGTCGAAA
GCTTCACCTTGGATCAGATCATAGAGAGTTCCAGCATTATTTATGAGCATGATGACTCCGAGACCCAGGA
AGACAGTTTTGTGATTAAACTAACAGATGGGAAGCACTCTGTGGAAAAGACGGTCCTCATTATAGTTATC
CCTGTTGATGATGAGACGCCCAGAATGACTATCAATAATGGACTAGAAATAGAAATTGGGGATACCAAGA
TTATCAACAACAAAATATTAATGGCAACAGATTTAGATTCAGAAGACAAATCTTTGGTTTATATTATTCG
TTATGGGCCAGGACATGGCTTATTACAGAGACGAAAACCTACTGGTGCCTTTGAAAATATCACACTGGGC
ATGAATTTTACCCAGGATGAAGTAGACAGAAACTTAATTCAGTATGTCCATTTGGGGCAAGAGGGCATTC
GGGACCTAATTAAATTTGATGTGACTGATGGAATAAATCCCCTCATAGATCGTTACTTTTATGTGTCCAT
CGGGAGCATTGACATTGTCTTCCCTGATGTGATAAGTAAGGGAGTGTCCTTGAAAGAAGGTGGCAAAGTC
ACTCTTACAACAGACCTACTAAGCACTAGTGACTTGAACAGTCCTGATGAAAACTTGGTTTTTACCATCA
CCAGGGCTCCCATGCGAGGTCACCTGGAATGCACGGATCAGCCTGGTGTGTCCATCACGTCTTTCACTCA
GCTGCAACTGGCTGGAAACAAAATCTACTACATCCACACAGCTGATGATGAAGTGAAAATGGACAGTTTT
GAGTTTCAAGTCACCGATGGACGTAACCCTGTCTTTCGGACATTCCGTATCTCCATTAGCGATGTGGACA
ATAAAAAGCCAGTGGTCACCATCCACAAGCTGGTTGTCAGTGAAAGTGAAAACAAGCTGATTACTCCTTT
TGAGCTCACTGTCGAAGACAGAGATACTCCTGACAAGCTCCTGAAATTCACTATCACCCAGGTGCCTATT
CATGGCCATCTCCTATTCAACAATACCAGACCTGTCATGGTTTTTACCAAGCAAGACTTGAATGAAAACT
TAATCAGCTACAAACATGATGGCACTGAGTCAAGTGAAGATAGCTTCTCCTTCACAGTGACTGATGGCAC
CCATACAGACTTCTATGTTTTTCCTGATACGGTGTTTGAAACAAGGAGACCCCAAGTGATGAAGATCCAG
GTCTTGGCTGTTGACAACAGTGTCCCCCAAATCGCAGTGAATAAGGGGGCCTCTACACTTCGCACTCTAG
CCACTGGCCACTTGGGGTTCATGATCACAAGCAAAATATTGAAAGTGGAGGACAGAGACAGCTTACACAT
TTCTCTTAGATTTATCGTGACAGAGGCCCCTCAACATGGATATCTTCTCAACCTGGACAAAGGCAACCAC
AGCATCACTCAGTTCACACAAGCTGACATTGATGACATGAAAATATGCTATGTCTTAAGAGAAGGGGCTA
ATGCCACAAGTGATATGTTCTATTTTGCAGTTGAAGATGGTGGTGGAAACAAGTTAACGTACCAGAATTT
TCGTCTGAATTGGGCATGGATCTCCTTTGAAAAGGAATATTACCTGGTCAATGAGGACTCCAAATTTCTA
GATGTTGTTCTTAAACGTAGAGGTTACTTGGGAGAAACTTCTTTTATAAGTATTGGCACAAGAGACAGAA
CTGCAGAAAAAGACAAAGACTTCAAGGGCAAAGCACAGAAACAAGTGCAGTTCAACCCAGGCCAGACCAG
GGCCACATGGCGAGTGCGGATCCTGAGTGATGGGGAGCATGAGCAGTCTGAAACCTTTCAGGTGGTACTC
TCAGAGCCCGTGCTGGCTGCCTTGGAATTCCCCACAGTCGCCACTGTTGAGATCGTTGATCCAGGAGATG
AGCCAACTGTGTTTATTCCCCAGTCCAAATACTCCGTTGAAGAAGATGTTGGTGAGCTGTTCATTCCCAT
CAGGAGGAGCGGAGATGTGAGCCAGGAGTTGATGGTGGTCTGTTATACCCAACAAGGAACAGCAACTGGA
ACTGTGCCGACTTCCGTGTTGTCTTACTCTGATTACATATCCAGGCCTGAGGACCACACCAGTGTTGTCC
GCTTTGACAAAGATGAACGGGAGAAACTGTGTCGGATAGTCATAATTGATGACTCTTTGTACGAGGAGGA
GGAAACCTTCCATGTCCTTCTGAGCATGCCCATGGGGGGAAGAATCGGATCAGAGTTCCCAGGGGCTCAA
GTTACAATCGTTCCTGACAAAGATGATGAACCCATCTTTTACTTCGGTGATGTGGAATACTCTGTGGATG
AGAGTGCTGGCTATGTGGAAGTGCAGGTGTGGAGAACGGGCACTGACCTGTCCAAGTCTTCTAGTGTCAC
AGTGAGGTCTCGGAAAACAGATCCTCCCTCTGCAGATGCTGGAACAGACTATGTGGGCATCAGCCGTAAT
TTAGATTTTGCACCTGGAGTCAACATGCAGCCTGTTCGTGTTGTCATTCTGGATGACCTTGGACAACCAG
CGCTGGAGGGAATTGAGAAATTTGAACTGGTGCTTCGCATGCCTATGAACGCAGCCCTTGGCGAGCCCAG
CAAAGCCACAGTGTCCATAAATGACTCTGTCTCCGATTTGCCTAAGATGCAATTCAAAGAACGAATATAT
ACTGGCAGCGAAAGTGATGGGCAGATAGTTACAATGATCCATAGGACTGGGGATGTCCAGTACAGATCTT
CAGTGAGATGCTACACCCGGCAGGGGTCTGCACAGGTGATGATGGACTTTGAAGAACGCCCAAACACTGA
TACCTCCATCATCACATTCCTCCCTGGTGAGACAGAAAAGCCCTGCATTCTTGAGCTGATGGACGATGTG
CTCTATGAGGAGGTAGAGGAGCTCCGCCTGGTACTCGGCACTCCACAAAGCAACTCTCCCTTTGGGGCTG
CAGTTGGTGAACAAAATGAAACTCTCATAAGGATCCGAGATGATGCTGATAAGACTGTTATTAAATTTGG
AGAAACCAAATTTAGTGTCACTGAACCCAAAGAACCTGGAGAGTCGGTGGTTATAAGAATTCCAGTGATT
CGCCAAGGAGACACTTCAAAGGTTTCCATTGTGAGAGTCCACACCAAGGATGGCTCGGCCACCTCTGGAG
AAGACTACCACCCTGTGTCAGAAGAAATTGAGTTTAAGGAAGGGGAAACCCAGCACGTGGTTGAAATCGA
AGTTACCTTTGACGGGGTGAGAGAGATGAGAGAGGCCTTCACTGTTCACCTAAAACCTGATGAAAATATG
ATAGCAGAGATGCAGTTGACGAAAGCCATTGTGTACATAGAAGAAATGAGCAGCATGGCAGATGTCACTT
TTCCTTCTGTCCCTCAAATTGTATCCCTGTTGATGTATGACGACACTTCCAAAGCTAAGGAGAGTGCTGA
ACCCATGTCTGGCTATCCTGTCATCTGTATCACAGCTTGCAACCCCAAATATTCAGACTACGATAAAACA
GGCTCTATCTGTGCAAGTGAGAACATCAATGACACTTTGACGCGGTACCGGTGGCTGATTAGTGCACCTG
CGGGCCCTGACGGTGTGACCAGCCCTATGAGAGAAGTGGACTTCGACACCTTTTTTACGTCATCCAAGAT
GGTCACACTGGACTCCATATACTTTCAGCCTGGCTCCCGGGTACAGTGCGCAGCTCGTGCTGTGAACACC
AATGGGGATGAAGGCCTGGAGCTCATGAGCCCTATTGTAACCATCAGCAGAGAAGAAGGTCTTTGTCAGC
CCCGTGTACCTGGGGTTGTTGGAGCAGAGCCGTTCTCAGCTAAATTGCGCTACACAGGCCCTGAGGATGC
AGACTACACAAACCTTATCAAGCTCACTGTCACAATGCCACACATAGATGGCATGCTCCCCGTGATCTCC
ACTAGAGAGCTTTCCAACTTTGAGCTCACCCTCAGCCCTGATGGCACAAGAGTTGGAAACCACAAGTGCT
CCAACCTCCTGGATTATACTGAAGTGAAGACTCATTATGGTTTCTTGACTGATGCTACCAAAAATCCAGA
AATAATTGGAGAGACATATCCTTACCAGTACAGCTTGTCCATCAGAGGTTCCACTACCTTGCGCTTCTAC
CGGAACCTGAACCTAGAGGCCTGTTTATGGGAGTTCGTTAGCTACTATGACATGTCAGAACTCCTTGCTG
ACTGTGGTGGCACCATTGGAACAGATGGACAGGTCCTAAACCTAGTGCAGTCCTATGTGACCCTTCGAGT
CCCTCTGTATGTTTCCTACGTGTTCCATTCCCCCGTGGGGGTAGGAGGCTGGCAGCATTTTGACTTGAAG
TCAGAGCTTCGTCTAACTTTTGTGTACGACACCGCCATCTTGTGGAATGATGGAATTGGCAGCCCCCCAG
AGGCTGAACTTCAAGGTTCTCTCTATCCAACCAGCATGCGCATCGGTGATGAGGGGCGCTTGGCCGTGCA
CTTCAAGACAGAGGCTCAGTTCCATGGCTTATTTGTGCTGTCACATCCCGCATCCTTTACAAGCTCAGTG
ATCATGTCAGCTGATCATCCAGGCCTGACATTTTCCCTCCGCCTCATAAGGAGTGAACCAACCTATAACC
AGCCAGTACAGCAGTGGAGCTTTGTCTCTGACTTTGCCGTACGTGACTACTCAGGGACCTATACTGTGAA
GCTGGTGCCATGCACTGCCCCATCACATCAGGAATACCGCCTGCCAGTCACCTGCAACCCCAGAGAACCT
GTCACCTTTGACCTTGACATCCGATTCCAACAGGTCAGTGATCCAGTGGCTGCTGAGTTTAGCTTGAACA
CCCAAATGTACCTGCTCTCTAAGAAGAGTCTCTGGTTGTCTGATGGATCCATGGGATTCGGGCAAGAGAG
TGATGTTGCTTTTGCAGAAGGTGATATAATTTATGGTCGTGTCATGGTGGATCCTGTCCAGAATCTGGGT
GACTCCTTTTACTGCAGCATTGAGAAGGTGTTTCTATGCACTGGAGCTGATGGCTATGTTCCCAAGTATA
GTCCAATGAATGCAGAATATGGCTGCTTAGCCGACTCTCCTTCACTCTTATATAGATTTAAAATTGTGGA
CAAAGCTCAGCCAGAGACACAAGCGACCAGTTTTGGAAATGTCCTATTTAATGCCAAACTAGCAGTGGAT
GACCCTGAAGCCATTCTCTTAGTGAATCAGCCTGGATCTGATGGATTTAAAGTCGACTCAACACCACTCT
TTCAGGTCGCTCTAGGCCGAGAATGGTATATACATACGATCTATACAGTGAGATCGAAAGACAATGCCAA
TCGAGGTATTGGCAAAAGAAGTGTGGAGTACCATTCTCTGGTGAGTCAAGGAAAGCCCCAATCCACCACC
AAGAGCCGGAAGAAGAGAGAGATCAGGAGCACACCCTCACTGGCATGGGAGATTGGTGCTGAAAACAGTC
GAGGAACAAACATCCAGCACATTGCCCTGGACCGCACCAAGAGGCAGATCCCCCATGGGAGAGCACCTCC
AGATGGCATCCTCCCCTGGGAGCTCAACAGCCCCAGCTCTGCAGTCAGCCTGGTCACTGTGGTGGGAGGC
ACCACGGTAGGGTTACTCACCATCTGCCTCACTGTCATTGCAGTGCTGATGTGCAGGGGCAAGGAAAGTT
TCAGGGGGAAGGATGCCCCGAAAGGCTCCAGCAGCAGTGAGCCCATGGTGCCCCCACAGAGCCATCACAA
TGACAGCTCAGAAGTTTGATGACTGCAGGTAGAATTCAACCTTTTCCGTAAGTGCCTCGGAAAAGATCAC
AATGGAACCTTAAATACTTCTGGTAAACCATAGAGAATGGAGGATGGCTGTGATGAAGCTGCTTAGAGAA
TATGACTGTACTAATGGAGTTTGATTTGAATTCTCCATACTCTTTTTTGCATCAAAGGACAAATTAAGGC
ATCTTTCCTCTTGCCCCAAAGGCAGCAACAACGTACTCATATGTACACAGAGCCATGATGTGAGGAATGT
ACTCCTCATTTTAGACATATTCTCTATGCAGTGGAGATAAATCTATTAAAAGGTGCTAACAGACTCTCTT
ACAAGTGTAAGAGGAATCTACTGTTGCTATGTTAGTGTGAATGTTGAAGGTGCAATTATCACATTGTTTA
TTAATTGTATAACAGATTATTACTAGAAAGGTTTTTGTTGCTAGTCTGGAAAACTGGTGAACACACTGTT
TATTATGACAAGTTTTCAAATAGGTGAAGACAGCATAGAATTATGACCAGGGTGGCTCAACCCACAAATC
AACTGATCTACTACTTGGGAGACAGTGGAAGGAAAGATAGAGGGAAGGAAGTTCACTCACTTGAATTTGA
ATTGCTTCTCATTCTCATCAGACTCTCCTTGTTTTGTTTGCATATTTAATTTTAAATTAAACCAAAGAAT
ATGTTAATTCTGAAAGAGATTTTTAAGAGATGCTGCTCTGTTTTGGCATATAGTGAGTAATGGTAGAGCT
CTTGCATGGTAATATACCTTATTGGTGCTCAACATTTGTGGGAAATTAGAGGGTTGGTGAGATTTTGGTG
ATGAATAAATGCCATAGAGTTAGAGTCACTACAAGACAATGTTCTCTAAGAACTGAGCCTAGATGTTTGC
AGTATTGAACCCATAAATGATAATAAGAAACATTGTTACAGATGGTGAAGGGAGAAAGTGGTATTTATTA
ATATAATGTGTATAATCAGAGTGCCTCTTATACATACTTTATAGAATAAAGGAACATTTTGACAGATGAG
GTTATCCCTCGGAGTAGCGTAATCACACAATAACATTTAGAACTTAAATTGGCTACAGGACATTTTATTA
GCTTTCTATCCAGCATCTGGTCCAAACGATGGGACTCTCTGCAACTATCATTCCAGAAATGGTCTTGGAG
GTGGCCAGAATCATTGACCATATTTTTATTTGGTTCAAGAAGACATCGCTCTGGCATCCCCAGTTCAGTG
AACTGGTACAATGTGGTCCCTCTCAATATTTAAAAATATAATTTGTAACAGTGCTTACCATTCACCTCCC
AAAGCCAAGGAACTTGAGTGAGCTTCCTTGGCAAGCCTCCCATTGCCTTTCTGCATCAATGTGTTTGTTA
CCAAATAGCAGAAATTTCGCTTAGAAGGGGAAAACTTCAGCTTTCCAAAAGCTAGTAAACATGTTTCAAA
GAAAAATAAGGTCAGGAGAAAAAGAATAATGCCTACAGATTATCCTTCAGATGCTGGCTAGAATCCCCTT
TGACTTCTAGCCATAAGCTGGCCACATTGGACATCTTGGTCACTGCAGAATTTTAAAAGGCAAACTTCTC
AGAACAGATGTGCACATCTTAATTTGGTGTCTGTAAGTATCAACCATTTCTTGATCAAGATAAGGAAGCA
ACACTGATACTGAGAGAGAGGTCATATGTCCAATAGTTGCCTTTCTTCTCTTAGGCAGCTCTGCACTTCA
TGTTCAGTTTTTTAAAAATAGACTGTAGTATCCTTTCATTGGAGAATTTACAAAAATATCATCTACAGCT
CAAAAGTCCCACTAACGGCTTATATGAACAGAAAGTACTGTGTAGCCCAGGAGTTTATTTAGCAAGATAA
ATAGTGGTAATTTCTTAATCATTCCCCTTTCCTTTGCTTTACCTTCTGGCAGATGCTTAGCTACTTCTTT
GGCTACCTCATAATTTGTATGGGAATGAACATGAATTAGGGAACTTCAAATAGTGCGTAGACTTTTCCCT
ACTTACCATTGGGTTCAATTGATGTAGACTGTTAGAGCAAGTATACTCAATCAACTTGCTGATATTTTAG
TAGTTAACAGCTTCCGAGCCTATCATGCAATTTGGAGTCTGTCAATGAATATAGCAATCGGTGAAGCATT
ACTGTACGAAGTCTGTTTTCAGGCTTTGGGTCAAGCTGGTTTTATACCAAATTTCACTCTACAATGCATA
TTCTAATGAAGCTACTTTATATAAATTGGAGAGCTTATAAAATGCAGAACATTTCTATCCTATCCTACCA
AATATTTATCCTTCTCTGTCCTCTATTCTCTTACTCTCCTCTCTCCCTTTTTCCTTCCCTTTATTCCCTT
GAAAAAAGAGAATCTGTGGGAAATAGGCAGATATAGCTTTTTAAAATATAAAGTACTTGGGATTTTGCAT
TATTTTTCTTAATATCTATTTACTAAGTATGTAATTTAATATACATTAATTATTTTTTGAAACTCTTGTT
AGTGGGAAGAATATGGTAAATTTTTTGTTAAATAAAATAGACCCTTATGTTTAGCATTTTGTTTTTAGAG
AACTATTCTGGTACTATCAGAACAAATACATAAAATAACTTCCCATAGAGAACAGGATATAGCAATAATA
GCTCCTTAGATACTCAGTGGCTTCTGACTCCAATCAAGGTCTTGTTGATATTATATAGTAAAAATAAAAC
CAAAAATAAATATTATTCAAGTGGCTCTTCTAAGCATGTGAATCATGAAGCACTGAAATATGTATTTTAA
TGATGATCTTATTTATTCCCATTTTTGCCCTTAGTTAACATTTACTGGTGCTCACCTAGGATTGGCTATT
CTGAGGGATTGCATAGAAACCAAGCTCCACTTGCTGTCCTTGGGAAGGTTATAACTGAATGCAGCTCTTT
ATTTGGACTAAAGTGTCAGGATATGCATTAGATTCTCTCCTGAACCAAAAACACAACAGTCATTATCTGT
GAACCATAATTTAAAAATCTTTCTAGAATAACAACAGCAGACTCCACTCTTGTTTGTCTAAAAGAGCCCT
ACTGGGTATGGATCATTCTGATGACAGATTTATACAAAATGATTCAAACCAGTAACTTAGTAAAATTGAC
CTTCGCAAAACCTCACTGGGGGAGTGCCTTGTAGAGCTGTGGGTGGGACTGCACATTCTTTTCCTCTTAG
TAAAAGATAGGCCCACTTTATTCCAAGAATAACACTTAGCACATAAACTCTTCTTCCAGCTCGTTAGCAG
CATTAGCACCTTCTGAATTCCACCCTCTCAGAAGAATCCACAGTGTTTGAACAATTTGCATAAAGGTCAG
CTAGCATCCTGCTGCCAAGCCACTGCATAGCATTTGTGATAAGAAGGACCAACTCTAGGCTCAATATGAA
GGGATTTAGTTCTGTAAGCAGCAAAAAAGCTTCTTTATCAAGTCATCTTACCTCTAATTCTTTTCCAGTG
TGCCAACTCCAAAGTCAACATTAAAAATGTAAATGGACCTGTGTAAATATCACAGAGAGCTTTTCCTTAT
ACATCTCAATGCTGAGAGTTAAAATATTCCCAGGTTAAAATTTTTTTAAAGTACCAATAATAGAGCTAAA
TACAATGACATTTGCTTTTAAAAGGTGGATATTTTATTTCTGCTTTTTGAAAATACTTATTTAGTATTGA
CTTGGAAGCCAATTTGGTCCTTTAATAAGTAAAGAAAATAATATGTTTAAAAATGTAAATGTTTTACAAA
TTTGAAACTTTCATAATTGTATTAATCAGAAAACAAGCACATTGCCATTCTTTGAAACTCATGTTTCTAG
ACATGACAGCAGTAATAAAAGGATGAAAACAAGTGTCTTCACTAAGCGTATGGCCAATAAATGGGACCCA
AACGTTCAATCTGTTCAGTTTACCAAGGTTCAGAAATACGTAATTTAGCAGGAAACTATAAATACCAGTG
CTATCACAGCCACACATACACACACACAGACATAAAATAACCAAACATCTCATTTCTAGGAAAGAGATAA
CACTAAAGGCATCATAGGTTTAACTGAAATACGTTATATGAAGTTTTACAAAAAGGTCAACAGAAAGCTC
ATTTGTGAAAACATACTCTCATGGGAGCTTCTTTAACATTAGTTCAGAGGTTAATATATTTCCTGGAGGT
GTTTTCCTAGAATTGATTGCACTATTGCATGGTAATAACATTTAATTGTTAAGGAAACATTATATATAGG
TTCAAATTATCCCTTAATGTTGATTTCTCCCCTTTTCCATGGATTTTGATACTAAGAAACAAAATGCTTT
GAGATTTTGGTAACTATTTTGATTTTGATAAAACATGTTAAAATAGAAGGACATGATATTTTTCTATAGT
TTCCATCAGGAAGAGTACATCAGAAACTTCTCCATAAGGAAAGAAAACTGACTCTCTCTTGAACTAGTGT
TGACAAAATACACTAATGTCTTTCTTAATTTTATTTTATTAGGAGAAAAATCAGAATATTAAATTTGCAA
ACTTTTGAACAGCAGTAATAGCTCCTTAGACACTCAGTATCTTTCTTCCCTATCTTTCAAGCACATTTAA
TTTCTTTCCCCTGGTATTTGTTTGCTTTGTGTTTTTTCAATATTTTGTTTGCTAAAGAACAATAACAACA
ACAAAGCTGGTCCAGCCCTGACACCTACTTTTGCTTTTTTTCTTTCTTTCTTTTAATTTGTTGAACTATA
GGTTTCTTTCTGAGATGTATTTTTCATTCTTCCAATAATGCTCTCTTTTTCATTTCAAAACCATTACCAC
TTTCAATATGTAATTAACATCCTCATTCATCAGAAAGCTGGTAAGTCCACACAGCATTTGTGCAGTATCC
CTTCTGTGTAAAATGTTAAGGCTTTCAGATGAAAGAAAAAAGAACTTCCTGCAAAAGATCAAAAGCATCA
TACTAAATAAAATGATGACAATATGTGCCTTGATTTTTCTCTCAATGGAGGTTCAACATTGACATTTAAG
ATGTAAAAAAAATTACTTTGATGGTTTAATTAAGAATAATAAGTCAAATATCACATGTATGTAGTTCTTT
TGGATGACCGAATACCTTAAAATGAACTAAATAACTGAAATAAAGTGTTAAAATGTTAACAGCGTTGAAG
TTTTTAAAATTATAATTATCAAATGCACAATGTTCTTTTACTATGCCAAATGTTGCCTACACTGATTACA
TGATTGTCACAGTTTAAGTGAATTTCTACTATGGATCTTTATTTTCCCCAATGTTTGGATCATCCTCTCA
GATAAGAATTGTCAGTATTGCACCTCAAGAAAGAAGAAAAAATAAGAATGTAAATTTTTAAAAGCTAGCA
TTAAAAGTAAAGAGCAGTACAATAAAAATCACTTAAAATAGAGAAAGGCAACTACTGAGTAAGAAGAAAA
GATAATTTCTGTAAAAGCTAAATTTATGCACATTACAAAAAGTAGTCAAGTCAGTCTTCCATTGTGACTT
CAGGAATTCAAATGCAAGTTGTTGGCAAAATATATATATACACACACACACACATACACACACATATATG
TACATACATATATATATAGAGAGAGAGAGATAGATTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTTGC
CCAGGCTGGAGTGCAATGGAATGATCTTGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGTGATTCTCC
TGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGTGCCCACTACCATGCCTGGCTAGTTTTTGTATTTTTA
GTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGATCTCGAACTCCCAACCTCAGATGATCCTCCCGCCT
CCACCTCCCAAAGTACTGGAATTACAATGGCGTGAGCCACCACAAGATATTTTTAAAGCCCATTTGTCTA
TAAAAGAAAACTCTTGGACAAGGAGCTTTGTGTTTTATAATTGTATTACGTGCCTGCTTCCTTACCAAGT
GCCCTCCATAACACTAAGTAAATTTATATTTATCTAGCCTCTGAGTGACATATCTGTGTGTAATGGAATT
ATTTGCAGAATTTAATAGCCTTTTTTATTTTCGCATGAGAATTTTTCAAAAACTATCAGGGTCTAGTTTT
ATCATACATTTACTAAGTTACTACATATTGGTGGATATTGACGTTTATTCCTGGGAATCTAATTTTGCAA
ACAATTTGGAGCCATTCAGTCATAAATTCATGTCAACAATAAGTCTTGCTGCCGCTTGTGTTTCATAACT
ACGCTTGCTTTCCTTCAAAATATACCAAGTGTGTAATATAAATAAAGCCCATATCAATATAAAAAAAAAA
AAAAAAAAA

Композиционный код 6:

5,3,5,5,3,5,5,3,4,4,1,1,3,2,3,5,5,2,5,3,3,5,5,3,5,5,3,5,5,2,3,2,5,3,5,5,3,5,3,3,4,4,4,1,1,1,2,5,5,5,
2,3,5,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,4,4,2,5,5,2,3,3,5,3,4,4,4,3,5,5,5,3,5,5,2,5,3,5,3,3,1,1,4,1,3,2,1,4,1,
1,4,1,6,1,2,5,5,3,5,5,3,1,4,1,4,2,1,1,1,1,1,3,3,2,2,5,2,4,4,1,4,4,4,4,4,4,4,3,5,5,2,5,2,1,1,1,4,2,5,
5,3,1,1,1,1,4,1,4,1,3,3,4,4,4,3,2,5,5,3,3,5,5,5,2,4,4,4,1,1,2,4,4,4,3,5,5,3,3,4,4,4,3,5,5,3,1,4,4,1,
1,4,1,1,4,1,1,1,4,3,5,2,2,5,5,5,2,5,5,5,2,4,1,1,4,3,1,1,1,1,4,1,1,3,5,3,1,1,4,1,1,3,1,4,1,4,1,1,4,3,
4,1,1,1,4,4,1,4,1,3,5,5,5,2,5,2,2,5,2,2,5,2,4,1,4,1,4,1,1,1,1,4,1,3,5,3,5,5,5,3,4,4,4,3,1,4,4,4,1,1,
3,1,4,1,4,4,1,4,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,4,1,1,4,1,1,1,1,4,4,3,5,3,2,3,1,1,1,1,4,1,1,3,2,2,5,3,5,2,1,
1,4,1,3,1,4,6,1,1,3,3,5,5,3,2,5,5,5,3,5,5,2,5,5,3,5,2,2,1,1,1,1,2,1,6,4,4,1,4,3,2,2,5,3,3,5,5,5,3,3,
5,3,1,1,1,1,1,3,4,4,1,1,2,2,4,1,1,1,3,2,5,5,5,3,1,4,1,6,6,6,6,1,4,1,1,3,2,4,4,1,4,1,2,4,4,4,2,5,5,3,
3,5,3,5,3,1,4,1,1,1,1,3,3,3,2,5,5,3,1,1,1,1,1,4,1,1,3,3,1,1,4,1,3,5,5,5,3,5,5,3,4,4,1,4,1,3,1,1,1,1,
3,3,3,5,3,1,1,1,1,1,3,3,5,3,5,5,2,5,3,2,3,2,2,3,2,5,3,3,5,5,5,2,4,4,1,1,6,1,2,5,3,4,4,1,1,4,3,5,3,3,
3,5,3,5,3,5,3,5,5,5,2,5,3,2,5,3,3,5,3,1,1,1,1,1,3,5,3,5,2,3,2,5,5,2,4,4,4,3,4,4,4,3,3,5,3,5,3,5,3,3,
5,3,5,5,3,3,5,5,5,3,2,5,3,5,5,2,1,1,1,4,1,1,1,3,3,5,3,1,1,4,4,1,1,1,4,4,3,4,4,4,3,2,2,1,1,1,1,2,5,3,
4,1,1,1,1,3,5,3,5,3,5,5,2,3,3,5,3,1,1,4,4,4,2,5,2,5,3,3,2,4,1,1,4,1,3,5,5,3,2,3,5,5,3,2,3,3,3,5,5,3,
3,5,5,5,2,5,5,3,3,5,5,3,5,3,5,5,3,3,5,3,5,3,5,5,5,3,3,5,3,5,3,1,1,1,1,4,2,3,3,5,2,2,5,2,1,1,1,1,1,1,
2,2,1,1,1,4,1,3,3,5,3,5,5,3,3,3,5,2,5,2,5,5,5,2,3,3,5,5,3,5,3,5,3,3,3,4,4,4,2,5,5,3,5,3,3,5,3,3,5,3,
5,5,3,4,1,4,1,3,5,3,5,3,3,5,5,2,5,3,5,5,5,2,2,4,1,1,1,1,4,1,1,3,5,5,5,2,3,5,2,3,2,3,5,2,5,3,5,5,5,2,
5,2,5,3,3,5,5,2,5,2,5,3,1,1,1,1,3,5,5,5,2,1,4,4,1,3,3,5,3,1,1,1,1,3,3,3,3,3,5,3,5,5,3,3,3,4,4,4,3,3,
2,4,1,1,1,1,1,1,4,3,5,2,3,5,3,5,3,2,3,5,3,5,3,5,5,3,1,4,1,1,1,2,3,1,1,1,1,1,1,1,3,3,5,5,5,3,1,1,1,4,
3,5,2,1,1,1,4,3,3,2,5,3,3,3,5,3,5,3,5,3,5,3,5,2,5,3,3,5,5,5,3,5,3,2,4,4,4,3,2,5,3,1,1,1,1,1,1,2,3,5,
5,2,3,5,3,5,3,3,4,1,1,1,4,3,3,1,1,1,1,3,5,3,5,3,3,3,4,4,1,1,3,5,3,2,3,5,5,2,5,3,3,3,5,5,2,5,5,3,3,3,
5,3,5,5,5,3,2,3,5,3,3,3,5,3,3,3,5,3,5,3,3,3,5,5,5,3,5,3,3,3,1,1,6,1,3,5,5,5,3,3,2,3,5,3,5,3,5,5,5,3,
5,3,2,2,5,5,3,3,3,1,1,1,1,1,1,3,3,2,3,5,5,5,3,3,5,2,5,2,5,3,3,5,3,3,3,5,5,3,5,2,3,5,3,3,3,5,3,3,3,5,
3,3,5,3,2,3,3,2,1,4,1,1,4,3,3,3,5,5,5,2,3,5,3,2,3,3,5,5,2,2,5,3,3,3,3,3,3,2,2,2,5,3,2,3,3,3,3,1,1,1,
4,3,3,1,1,1,1,3,2,3,3,5,3,3,2,3,3,3,3,5,3,3,2,2,2,5,3,5,3,2,3,2,5,3,5,2,3,3,5,5,5,3,3,1,1,1,1,1,2,5,
3,5,5,3,5,3,3,5,5,3,3,5,5,5,2,3,2,3,3,3,3,3,5,3,5,3,2,5,3,1,1,1,1,3,2,5,3,5,5,3,3,3,5,2,5,5,3,5,3,3,
3,5,5,5,3,5,5,3,5,2,3,3,2,5,3,5,3,3,3,3,3,3,3,5,5,3,3,3,3,5,3,3,5,3,5,5,3,3,3,5,5,5,3,5,5,2,3,5,5,3,
5,5,3,1,1,1,1,3,5,5,2,5,3,5,5,3,3,3,5,3,3,1,1,1,1,1,3,5,3,3,5,3,3,2,2,3,5,5,5,3,5,3,1,4,1,1,3,2,3,5,
3,3,3,3,5,5,5,3,5,3,5,3,3,2,2,3,2,3,3,5,3,5,5,3,5,5,5,3,2,3,5,2,2,3,3,3,2,3,5,3,3,5,3,3,3,3,3,3,5,2,
2,3,5,3,3,5,3,2,3,3,3,3,5,3,3,3,5,2,5,5,5,3,3,5,5,3,3,2,5,3,5,3,3,5,3,5,3,5,5,3,5,5,3,5,5,2,3,3,3,3,
5,3,3,2,2,3,5,5,2,3,3,5,3,3,4,1,1,4,1,3,5,3,5,5,3,3,5,2,3,5,2,5,5,5,3,3,3,5,3,5,3,3,2,2,5,2,2,5,3,3,
5,5,5,3,3,3,3,5,5,3,3,1,1,1,1,3,5,5,2,3,5,5,3,5,5,3,5,3,3,4,1,1,4,3,5,3,5,5,3,5,3,2,5,3,1,1,1,1,1,2,
3,3,3,3,5,3,5,5,3,3,5,3,3,5,5,3,2,3,5,3,5,3,5,2,5,3,5,5,3,5,3,5,5,3,3,5,2,4,1,1,1,1,1,4,3,5,3,3,3,3,
4,4,4,3,3,3,3,5,5,3,5,3,5,3,3,3,3,1,1,1,4,3,5,3,1,1,1,4,3,3,3,5,3,5,2,5,5,3,5,3,3,5,5,3,3,5,5,3,5,5,
3,3,5,3,5,5,5,3,3,3,5,3,5,2,3,3,3,1,1,1,1,2,5,3,3,5,5,3,2,5,5,3,3,3,3,3,5,5,3,3,2,5,3,5,3,4,6,1,1,1,
1,1,3,3,5,5,3,5,5,3,5,2,5,3,5,5,5,3,2,3,5,3,2,5,3,1,1,1,4,1,6,1,2,5,3,2,5,3,5,5,5,3,5,5,3,5,3,3,3,3,
3,5,5,2,5,5,3,3,3,2,3,3,1,1,4,1,3,1,1,1,1,1,3,5,5,2,3,3,5,3,3,5,5,3,2,5,3,5,3,3,3,5,3,3,5,2,3,3,5,5,
3,3,2,3,3,3,3,3,2,5,5,3,5,5,5,3,3,3,5,3,5,2,5,5,5,3,3,5,3,3,5,5,5,3,5,5,5,3,3,2,3,3,3,3,3,3,3,3,5,5,
2,3,3,3,3,2,3,3,5,2,3,5,3,3,2,3,3,5,3,1,1,1,1,3,2,5,3,3,4,1,1,1,2,1,1,1,1,1,2,5,2,4,4,1,4,3,3,5,5,3,
5,5,3,3,5,3,5,5,2,5,2,1,1,4,4,3,5,5,3,5,5,2,5,5,3,3,5,5,3,3,2,2,3,5,2,3,5,3,3,5,5,5,3,5,5,3,3,3,3,3,
3,5,5,5,3,1,1,1,1,1,2,3,4,1,1,1,1,6,4,1,3,3,5,3,3,2,2,2,3,2,3,5,5,3,5,5,5,3,5,3,3,5,2,5,5,3,1,1,1,1,
3,3,5,5,3,5,3,3,3,5,5,3,5,3,5,2,5,2,3,3,5,3,1,1,1,1,1,3,5,5,3,5,3,4,1,6,1,6,4,2,3,5,2,2,5,5,2,5,3,3,
3,2,5,3,3,5,3,3,3,3,5,5,3,5,5,3,3,5,3,5,3,5,3,5,3,3,5,3,5,3,4,1,4,1,3,5,5,3,1,4,1,1,3,3,3,5,2,5,5,3,
5,3,2,3,3,5,3,2,3,3,2,2,5,3,4,1,1,1,3,3,3,3,3,2,3,2,1,1,6,1,3,3,3,3,5,3,5,3,5,3,2,3,2,5,5,5,2,3,5,3,
3,3,5,5,3,5,5,3,5,5,2,5,3,1,1,1,1,3,5,2,5,5,2,3,5,3,5,5,3,5,3,5,5,3,5,3,3,2,2,3,3,5,5,3,3,3,5,5,2,3,
2,5,5,3,5,3,5,3,5,5,5,3,3,2,5,3,1,1,1,4,1,4,3,2,1,4,6,6,1,3,3,3,5,2,5,3,3,1,1,1,1,2,5,5,3,3,5,2,3,5,
5,5,3,3,1,4,6,1,3,5,5,3,5,5,2,1,1,1,1,4,2,5,5,3,2,3,5,5,3,5,3,5,3,2,3,3,3,3,3,3,3,5,2,5,5,2,3,3,3,3,
5,3,3,3,3,3,2,3,5,3,3,3,5,3,3,5,3,3,3,2,4,4,4,3,2,3,3,2,5,3,5,3,2,5,3,2,5,3,5,3,5,3,1,1,1,1,3,1,4,1,
1,3,2,3,5,5,5,3,5,2,3,3,3,5,3,5,3,5,3,1,1,1,4,3,3,5,3,3,5,3,4,4,4,3,5,5,3,5,5,5,3,3,5,2,3,3,3,3,3,5,
2,2,1,6,1,1,4,3,5,3,5,5,2,3,3,6,1,1,6,2,3,5,3,3,3,3,5,3,3,3,2,1,4,1,6,3,5,5,3,5,3,3,5,5,3,3,3,5,5,3,
5,3,3,5,5,3,5,2,3,5,5,5,3,3,2,5,5,3,3,2,5,3,5,3,2,3,5,5,5,3,5,3,1,4,4,1,4,1,4,3,3,2,3,5,5,3,5,3,5,5,
5,3,5,3,3,4,1,1,1,1,3,3,5,2,1,1,6,1,2,5,5,5,2,5,3,5,3,4,4,4,2,5,5,2,3,3,3,5,5,5,3,5,3,3,1,4,1,1,6,1,
3,3,2,5,5,5,3,3,3,3,3,3,5,5,3,2,3,5,3,3,2,2,5,5,5,2,3,3,5,5,5,2,5,3,5,3,2,5,5,2,5,3,5,5,5,3,5,2,5,2,
5,2,3,1,6,1,1,4,1,1,3,3,5,3,5,5,3,1,1,1,1,1,3,3,5,2,3,3,2,1,1,1,1,1,1,1,4,3,3,3,3,5,5,3,3,3,3,5,5,3,
3,3,5,3,3,2,3,2,3,2,5,2,3,3,1,1,1,1,1,1,1,3,3,5,3,1,1,1,1,1,4,1,4,1,2,5,5,3,3,5,5,5,3,5,5,3,5,5,2,3,
5,3,3,5,3,3,5,5,3,2,2,3,2,5,5,2,5,2,5,5,5,3,5,5,3,2,5,3,5,3,3,1,1,4,1,3,1,1,4,4,2,2,5,5,5,3,3,5,5,5,
2,5,3,3,2,3,3,4,1,1,1,1,1,1,1,3,3,2,3,5,5,5,2,5,3,3,3,3,3,3,5,3,2,1,1,6,1,1,3,3,1,4,1,1,1,4,1,1,1,2,
5,3,5,5,3,5,3,3,5,5,2,3,5,2,5,3,2,5,2,5,5,5,2,3,3,3,2,5,5,2,3,1,1,1,1,2,5,3,3,2,5,3,5,5,2,2,1,1,1,1,
3,5,3,5,3,5,2,3,5,5,2,5,5,3,3,4,1,4,4,2,5,3,5,2,2,3,5,3,4,4,4,2,1,1,1,1,1,3,3,3,5,5,3,5,3,5,5,2,5,3,
5,5,3,3,2,5,3,3,5,3,1,1,1,1,3,6,1,4,1,3,5,5,3,5,5,5,3,3,2,5,5,2,5,5,3,5,3,3,3,3,3,2,3,3,3,2,3,3,3,3,
4,4,4,3,3,5,5,3,5,3,5,5,3,5,5,5,3,4,4,4,3,2,5,3,2,3,3,5,3,3,5,5,3,3,2,5,3,2,3,3,5,5,3,5,5,3,3,2,5,3,
3,3,3,3,3,5,5,3,3,5,2,5,2,3,5,5,3,3,2,3,5,2,3,3,5,3,2,2,5,3,5,3,3,5,3,5,3,5,3,5,3,2,3,3,2,3,3,5,5,2,
2,2,5,3,5,5,3,2,5,2,3,5,3,2,3,5,5,3,2,5,3,5,3,5,3,5,3,2,3,3,5,3,3,3,5,5,5,3,3,5,5,3,3,2,5,5,3,1,1,1,
1,1,4,1,1,3,1,1,1,1,2,5,2,5,2,5,5,3,3,3,3,5,3,2,2,2,1,1,1,1,3,1,4,1,1,1,1,1,1,1,1,3,5,3,2,3,2,3,1,1,
1,1,1,1,1,1,1,1,1,3,2,1,1,4,1,3,5,5,2,4,4,4,2,5,3,1,1,1,1,1,3,5,3,2,4,4,6,1,1,1,1,3,3,1,1,4,1,3,5,5,
3,1,1,1,1,3,1,1,6,4,1,2,5,5,3,5,3,5,5,2,3,3,1,1,4,1,2,3,5,5,3,5,3,5,5,5,2,3,3,5,3,2,5,3,3,3,3,3,3,2,
5,3,5,5,3,5,3,3,3,3,3,5,3,2,1,4,1,1,1,3,5,3,5,3,5,3,3,3,3,5,5,3,2,3,3,5,2,3,1,1,1,1,3,5,5,3,3,3,3,3,
5,5,2,5,2,5,3,5,3,3,3,3,3,3,3,3,3,5,3,2,5,5,2,3,2,3,3,3,3,5,3,5,3,5,5,3,5,5,3,2,5,5,2,3,5,3,3,3,5,5,
5,3,3,5,3,3,3,5,5,3,5,3,3,3,2,3,5,3,5,5,2,5,5,3,3,3,3,5,3,3,3,3,5,5,3,2,3,5,5,3,5,3,3,3,6,1,1,4,3,3,
5,2,3,3,4,1,1,1,1,2,5,3,2,5,3,3,3,5,5,3,3,5,2,3,3,3,3,5,3,5,3,5,5,3,5,5,5,3,3,5,3,3,5,3,5,3,3,2,5,3,
5,3,3,5,3,5,3,3,5,3,5,5,3,3,5,2,3,3,1,1,1,1,1,3,5,5,2,2,5,3,3,3,3,3,3,5,5,3,3,3,4,4,4,3,3,5,5,5,2,3,
5,2,5,3,5,2,2,3,5,3,3,5,5,3,5,5,2,3,3,5,3,3,3,5,2,3,3,3,5,3,3,3,5,3,1,1,1,1,3,5,2,3,3,3,2,5,3,2,5,3,
5,3,3,2,3,3,3,5,3,3,2,2,3,1,1,6,1,3,5,5,2,2,5,5,2,5,3,5,3,5,5,3,3,5,2,5,5,3,3,3,3,5,3,2,2,3,3,2,5,3,
5,3,5,5,5,3,3,5,3,3,3,3,2,3,5,5,3,3,5,2,3,3,3,5,3,3,3,5,5,3,5,2,5,2,3,5,5,3,3,2,6,1,1,1,2,2,3,3,3,2,
3,3,5,3,3,5,3,2,3,5,3,5,5,3,3,5,5,3,5,5,2,5,5,2,5,3,5,5,5,3,5,3,3,5,3,5,5,3,3,5,3,3,5,3,5,5,5,3,2,3,
3,3,3,3,3,2,5,3,3,5,5,5,3,3,3,2,5,3,2,3,3,3,2,3,3,5,5,3,5,3,5,3,2,5,2,5,5,2,3,5,2,3,5,2,5,5,3,3,3,5,
3,3,3,5,5,3,3,2,3,3,3,5,5,3,2,3,5,5,3,1,1,1,1,2,5,5,3,1,1,1,1,1,3,3,3,5,5,3,3,5,3,3,3,3,1,1,1,1,3,2,
3,2,3,3,5,3,5,3,2,2,5,3,3,5,3,3,5,3,3,1,1,1,1,2,3,5,2,2,5,3,3,5,5,3,5,5,3,2,5,5,5,3,3,5,3,3,3,5,5,5,
3,3,3,3,5,3,5,3,5,3,1,1,1,1,6,3,5,5,5,3,5,5,5,2,3,3,5,2,5,5,5,3,5,2,3,2,3,3,5,5,3,3,5,5,3,2,5,3,2,3,
3,2,5,3,5,5,5,3,3,3,2,3,5,5,3,3,3,3,5,5,3,5,5,2,2,5,3,5,5,3,5,3,3,3,5,3,5,5,5,3,3,2,2,3,5,3,2,5,3,5,
2,5,5,3,3,5,3,3,5,3,2,5,3,3,2,5,5,2,3,3,2,3,5,3,3,3,3,5,5,5,3,3,5,2,5,5,3,2,3,5,3,5,3,3,2,5,3,5,3,3,
5,5,3,3,3,5,3,3,5,3,3,3,3,3,3,5,2,3,5,5,2,5,3,3,3,2,5,3,3,5,3,3,2,3,3,5,3,2,3,3,5,5,2,3,3,3,2,5,3,3,
3,3,5,3,5,5,3,5,2,3,2,5,5,3,3,3,5,2,3,5,5,3,5,3,5,3,5,3,3,5,5,3,3,3,3,5,3,2,3,2,5,3,5,5,2,5,3,2,2,3,
5,3,3,5,5,3,3,3,5,5,3,5,3,2,1,1,1,1,1,2,3,3,3,3,3,3,5,3,3,3,3,3,2,3,5,3,3,5,3,5,3,3,3,2,5,3,3,2,3,5,
5,5,3,3,3,5,2,3,5,5,3,3,5,3,5,5,5,2,3,5,3,5,3,3,5,2,5,3,3,5,3,3,2,3,3,5,3,5,5,3,2,3,3,5,5,3,3,3,2,2,
5,3,5,3,5,3,5,3,1,1,1,1,3,5,2,2,5,3,5,3,3,2,5,3,3,3,3,3,3,2,2,2,2,5,5,3,3,3,3,2,3,1,1,1,1,2,5,5,3,5,
5,2,3,3,5,3,5,3,3,5,3,5,3,2,3,5,5,5,2,3,3,4,4,4,3,1,1,1,1,3,4,1,1,1,2,5,3,5,3,5,5,5,2,5,2,3,3,5,5,3,
5,3,5,5,2,5,3,3,4,4,4,3,2,2,3,2,3,3,3,5,5,3,5,3,3,5,5,3,3,5,2,3,5,2,1,1,1,1,3,3,3,5,5,2,5,3,5,3,3,3,
5,5,5,3,5,5,3,3,3,3,5,3,5,5,3,5,5,3,3,5,5,3,5,5,2,3,1,1,1,1,3,5,3,5,2,3,2,5,2,2,3,3,6,1,6,1,4,3,3,3,
5,3,5,3,5,3,2,3,5,3,3,5,3,5,3,3,5,5,3,3,3,3,5,3,5,3,3,3,3,3,5,3,5,3,5,3,4,4,4,3,3,3,3,5,3,3,3,3,3,3,
3,2,5,3,5,5,2,3,5,5,3,3,5,5,3,3,5,3,3,5,3,3,3,3,3,2,3,5,3,3,2,5,5,3,5,2,3,5,5,5,3,5,3,3,5,5,2,3,5,5,
2,1,1,1,1,1,1,3,3,5,5,3,3,4,4,4,3,5,3,5,5,2,5,3,3,2,5,3,2,3,5,3,3,2,3,2,3,3,3,2,2,5,3,3,5,5,5,3,5,5,
5,2,5,2,5,2,5,2,3,5,2,5,5,2,3,2,2,5,3,1,1,1,1,3,3,5,3,5,5,3,5,3,3,3,3,3,3,3,3,3,5,3,3,3,5,5,3,3,3,5,
5,2,3,3,3,2,3,3,5,5,3,2,3,1,4,1,4,3,5,5,3,5,5,5,3,5,5,2,2,2,3,3,3,5,2,5,3,2,3,5,5,3,3,5,3,3,3,3,5,5,
3,3,2,5,3,5,2,2,3,5,3,5,3,5,3,3,3,5,3,3,3,3,3,3,2,3,5,3,3,5,2,5,3,3,3,2,3,1,1,1,1,3,2,2,3,3,3,2,5,2,
5,3,3,5,3,1,1,1,1,3,5,3,3,2,2,5,3,5,3,3,3,3,3,5,5,3,3,5,3,3,3,3,2,5,3,5,2,2,2,2,3,3,5,2,5,3,5,3,3,5,
3,3,2,5,2,3,3,5,3,5,5,2,3,3,5,3,5,3,3,3,3,3,3,5,5,3,2,2,2,2,2,1,4,1,1,1,1,1,2,3,5,3,3,5,3,3,3,3,3,5,
5,5,3,5,3,3,3,5,5,3,3,2,5,5,3,5,5,3,3,3,3,5,3,5,3,5,3,5,3,5,5,3,2,5,2,5,5,3,5,5,2,3,2,5,5,3,3,2,2,5,
3,5,3,3,5,3,5,3,2,3,3,3,3,1,1,1,4,3,5,5,3,5,5,2,2,3,3,5,5,2,2,3,5,5,3,3,5,2,5,5,3,3,3,5,3,3,3,3,3,3,
3,5,3,3,3,3,3,5,3,3,5,2,3,5,2,3,5,5,5,3,5,5,5,3,5,3,3,5,5,5,2,3,3,2,5,3,5,3,3,5,5,3,3,3,3,3,3,2,3,5,
3,5,2,5,5,3,5,3,5,3,3,5,2,5,5,3,3,3,3,5,3,3,3,3,3,2,2,5,5,3,3,5,5,3,3,1,1,1,1,2,3,5,3,3,5,3,5,5,2,3,
5,5,3,3,5,3,3,3,3,3,3,3,5,3,3,3,3,5,5,5,3,3,3,5,3,3,5,3,5,2,3,3,5,5,3,3,5,2,3,3,2,3,3,3,3,5,5,3,2,3,
3,3,3,5,3,3,2,5,5,3,5,3,5,3,1,1,1,1,2,3,3,2,3,2,5,2,5,2,5,2,5,2,3,2,3,2,3,2,3,3,5,3,5,2,3,3,3,3,5,3,
5,3,5,3,3,3,5,5,3,2,5,3,5,3,3,3,5,2,5,3,3,5,3,2,4,1,1,1,1,1,1,1,1,1,4,3,5,5,3,5,5,5,2,2,2,5,5,3,3,3,
3,3,3,3,3,5,5,3,3,2,3,5,2,5,5,3,2,3,5,5,5,3,1,1,1,1,1,1,1,2,5,5,5,3,5,3,1,4,1,1,1,1,2,3,3,5,5,3,3,2,
5,5,3,3,3,2,3,2,3,5,3,3,2,3,2,3,3,5,5,5,3,5,5,5,3,2,5,5,5,2,3,3,3,3,3,1,1,1,4,2,3,5,3,2,5,3,3,3,2,3,
3,3,5,3,3,3,3,5,5,3,3,3,3,3,2,2,5,3,3,3,5,2,3,3,2,3,5,5,2,5,5,3,3,5,3,3,5,5,3,3,3,3,2,5,3,5,5,2,5,3,
3,3,5,5,2,2,2,3,3,3,5,3,3,3,2,5,2,5,5,3,5,5,3,2,5,3,5,3,3,2,3,3,5,3,5,3,2,3,3,3,3,3,

Вторичная структура (Пикотех-2017) весит около 6 мегабайт в стандарте PNG: https://cloud.mail.ru/public/KKjH/goMgmMGAn

На яндекс-фотки не грузится. Но самый интересный фрагмент удалось вырезать в программе Paint:

Сиреневым цветом отмечен виток необычной метиониновой спирали. В отличие от альфа-спирали у неё более длинный шаг. Метиониновая спираль отличается от обычной альфа-спирали примерно как резьба с более крупным шагом от резьбы с менее крупным шагом:

Шаг метиониновой спирали примерно на 25% крупнее шага обычной альфа-спирали. При этом на один виток приходится тоже 3.6...3.7 аминокислотных остатка Met.

Ещё один интересный участок этого белка 3916...4164. Он содержит все типы композиционных кодов: 1,2,3,4, но ... не содержит ни одного витка спирали! Интересно оценить вероятность случайной комбинации композиционных кодов такого типа. Напомню, что спираль возникает при трёхкратном (или более) повторении кодов 1, 4 или их комбинации. При этом третий код должен быть "4", либо спиральных кодов (1,4), идущих подряд, должно быть больше 3.

Белковая молекула кончается витком полилизиновой пи-спирали, похожей на винт Архимеда.

2017.12.05 17:53:30

2D диаграммы Пикотех белковых структур, исследованных методом РСА, версия 2017 года 6var.

СТРУКТУРА ДИАГРАММЫ ПИКОТЕХ 

СОКРАЩЁННАЯ ДИАГРАММА
Красный - альфа-спираль.
Оранжевый - 310-спираль.
Розовый - одиночный код альфа/310 спиралей.
Голубой - пи-спираль.
Зеленый - бета-спираль.
Сиреневый - метиониновая спираль. У неё более крупный шаг "резьбы", чем у обычной альфа-спирали.
Черный в сокращённом представлении и белый в развернутом означают либо неизвестный код, либо конец трансляции.
Циклическое повторение цветов - программная спираль.

ПОЛНАЯ ДИАГРАММА
Содержание столбцов
1 - порядковый номер аминокислотного остатка в белковой молекуле
2 - триплетный код
3 - однобуквенный код аминокислотного остатка
4 - трёхбуквенное обозначение аминокислотного остатка
5 - упрощённый композиционный код
6 - графическая интерпретация упрощенного композиционного кода
7 - композиционный код
8 - графическая интерпретация композиционного кода
9 - нота, которая звучит при установке данной аминокислоты в растущую белковую цепь
10 - графическое изображение ноты (или ударного инструмента)
Для новой версии Пикотех 2018 разработан Композиционный код 7var

Программные спирали - повторение последовательности композиций. Например, один код альфа-спирали, затем один код пи-спирали. n(35) задаёт программную спираль, а n3 или n5 - простые спирали (пи-спираль и альфа-310-спираль).

1111111111111111111 - прямая альфа-спираль
4444444444444444444 - прямая 310-спираль
3333333333333333333 - прямая пи-спираль
2222222222222222222 - прямая бета-спираль
232323 - программная 23-спираль
141414 - программная 14-спираль

1.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/ … p;uid=5TUD

Structural insights into the extracellular recognition of the human serotonin 2B receptor by an antibody

Ishchenko A, Wacker D, Kapoor M, Zhang A, Han GW, Basu S, Patel N, Messerschmidt M, Weierstall U, Liu W, Katritch V, Roth BL, Stevens RC, Cherezov V

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/CAA … play=fasta

>ENA|CAA54513|CAA54513.1 Homo sapiens (human) 5-HT2B serotonin receptor 
ATGGCTCTCTCTTACAGAGTGTCTGAACTTCAAAGCACAATTCCTGAGCACATTTTGCAG
AGCACCTTTGTTCACGTTATCTCTTCTAACTGGTCTGGATTACAGACAGAATCAATACCA
GAGGAAATGAAACAGATTGTTGAGGAACAGGGAAATAAACTGCACTGGGCAGCTCTTCTG
ATACTCATGGTGATAATACCCACAATTGGTGGAAATACCCTTGTTATTCTGGCTGTTTCA
CTGGAGAAGAAGCTGCAGTATGCTACTAATTACTTTCTAATGTCCTTGGCGGTGGCTGAT
TTGCTGGTTGGATTGTTTGTGATGCCAATTGCCCTCTTGACAATAATGTTTGAGGCTATG
TGGCCCCTCCCACTTGTTCTATGTCCTGCCTGGTTATTTCTTGACGTTCTCTTTTCAACC
GCATCCATCATGCATCTCTGTGCCATTTCAGTGGATCGTTACATAGCCATCAAAAAGCCA
ATCCAGGCCAATCAATATAACTCACGGGCTACAGCATTCATCAAGATTACAGTGGTGTGG
TTAATTTCAATAGGCATTGCCATTCCAGTCCCTATTAAAGGGATAGAGACTGATGTGGAC
AACCCAAACAATATCACTTGTGTGCTGACAAAGGAACGTTTTGGCGATTTCATGCTCTTT
GGCTCACTGGCTGCCTTCTTCACACCTCTTGCAATTATGATTGTCACCTACTTTCTCACT
ATCCATGCTTTACAGAAGAAGGCTTACTTAGTCAAAAACAAGCCACCTCAACGCCTAACA
TGGTTGACTGTGTCTACAGTTTTCCAAAGGGATGAAACACCTTGCTCGTCACCGGAAAAG
GTGGCAATGCTGGATGGTTCTCGAAAGGACAAGGCTCTGCCCAACTCAGGTGATGAAACA
CTTATGCGAAGAACATCCACAATTGGGAAAAAGTCAGTGCAGACCATTTCCAACGAACAG
AGAGCCTCAAAGGTCCTAGGGATTGTGTTTTTCCTCTTTTTGCTTATGTGGTGTCCCTTC
TTTATTACAAATATAACTTTAGTTTTATGTGATTCCTGTAACCAAACTACTCTCCAAATG
CTCCTGGAGATATTTGTGTGGATAGGCTATGTTTCCTCAGGAGTGAATCCTTTGGTCTAC
ACCCTCTTCAATAAGACATTTCGGGATGCATTTGGCCGATATATCACCTGCAATTACCGG
GCCACAAAGTCAGTAAAAACTCTCAGAAAACGCTCCAGTAAGATCTACTTCCGGAATCCA
ATGGCAGAGAACTCTAAGTTTTTCAAGAAACATGGAATTCGAAATGGGATTAACCCTGCC
ATGTACCAGAGTCCAATGAGGCTCCGAAGTTCAACCATTCAGTCTTCATCAATCATTCTA
CTAGATACGCTTCTCCTCACTGAAAATGAAGGTGACAAAACTGAAGAGCAAGTTAGTTAT
GTATAG

Программа Пикотех показывает следующую детализированную структуру.
Вторичная структура белка начинается с программной 35-спирали длиной 8 аминокислотных остатков. 8-ой остаток Ser является последним остатком программной 35-спирали и первым остатком пи-спирали, которая состоит из 4-х аминокислотных остатков. Далее идёт последовательность композиционных кодов 5233553, а за ней один виток альфа-спирали: 1111, образованный аминокислотными остатками LQST. Остатки SIP под номерами 38,39,40 образуют виток бета-спирали. Затем последовательность EEMKQI образует примерно половину витка программной 35-спирали. Остатки с 81 по 86 образуют гибридную альфа-310-спираль. Далее 87-90 идет пи-спираль. 94-98 - 310-спираль (полтора витка). 120-123 - один виток альфа-спирали. Участок 124-334 структурирован одиночными композиционными кодами всех типов. 335-341 - программная 355-спираль. 342-346 - программная 23-спираль. 346-351 - пи-спираль (примерно полтора витка). 360-363 - один виток 310-альфа-спирали. 378-383 - прямая альфа-спираль (полтора витка). 414-418 - альфа-310-спираль (примерно 1.3 витка).
431-435 - программная 23-спираль. 440-443 - гнутая метионином альфа-спираль (примерно 1.2 витка). 467-471 пи-спираль (примерно 1.2 витка). 469-480 - программная 3335-спираль.

2. 
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/pdb/5V56

Crystal structure of a multi-domain human smoothened receptor in complex with a super stabilizing ligand

Zhang X, Zhao F, Wu Y, Yang J, Han GW, Zhao S, Ishchenko A, Ye L, Lin X, Ding K, Dharmarajan V, Griffin PR, Gati C, Nelson G, Hunter MS, Hanson MA, Cherezov V, Stevens RC, Tan W, Tao H, Xu F

http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore … ureId=5V56
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/AAA … play=fasta

>ENA|AAA23367|AAA23367.1 Desulfovibrio vulgaris hypothetical protein 
ATGCCCAAAGCCCTCATCGTCTACGGTTCCACCACAGGCAACACGGAATACACCGCCGAA
ACCATCGCACGTGAACTTGCCGATGCAGGGTACGAAGTCGATAGCCGGGACGCGGCCTCT
GTCGAGGCTGGCGGTCTCTTCGAAGGCTTCGACCTCGTCCTTCTCGGATGCTCGACGTGG
GGTGACGACTCCATCGAACTGCAGGACGACTTCATTCCCCTTTTCGACTCCCTCGAAGAG
ACGGGGGCGCAGGGCCGCAAGGTGGCCTGCTTCGGCTGCGGCGACAGTTCCTACGAGTAC
TTCTGCGGGGCTGTCGACGCCATCGAAGAGAAGCTCAAGAACCTCGGTGCCGAAATCGTT
CAGGACGGTCTTCGCATCGATGGCGACCCCCGCGCCGCCCGGGACGACATCGTCGGCTGG
GCGCATGACGTGAGGGGCGCCATCTAG

Результаты программы Пикотех

4-8 - альфа-спираль
49-53 - альфа-спираль
57-60 - альфа-спираль
62-65 - альфа-спираль
67-71 - альфа-спираль
75-78 - альфа-спираль
80-95 - альфа-спираль
97-103 - альфа-спираль
105-108 - альфа-спираль
110-115 - альфа-спираль
115-121 - программная 35-спираль
120-127 - программная 3355-спираль
128-141 - альфа-спираль
143-148 - альфа-спираль

3.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/pdb/5W0P

Identification of Phosphorylation Codes for Arrestin Recruitment by G Protein-Coupled Receptors

Zhou XE, He Y, de Waal PW, Gao X, Kang Y, Van Eps N, Yin Y, Pal K, Goswami D, White TA, Barty A, Latorraca NR, Chapman HN, Hubbell WL, Dror RO, Stevens RC, Cherezov V, Gurevich VV, Griffin PR, Ernst OP, Melcher K, Xu HE

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/CAD … play=fasta

>ENA|CAD97623|CAD97623.1 Homo sapiens (human) hypothetical protein 
ATGAATGGCACAGAAGGCCCTAACTTCTACGTGCCCTTCTCCAATGCGACGGGTGTGGTA
CGCAGCCCCTTCGAGTACCCACAGTACTACCTGGCTGAGCCATGGCAGTTCTCCATGCTG
GCCGCCTACATGTTTCTGCTGATCGTGCTGGGCTTCCCCATCAACTTCCTCACGCTCTAC
GTCACCGTCCAGCACAAGAAGCTGCGCACGCCTCTCAACTACATCCTGCTCAACCTAGCC
GTGGCTGACCTCTTCATGGTCCTAGGTGGCTTCACCAGCACCCTCTACACCTCTCTGCAT
GGATACTTCGTCTTCGGGCCCACAGGATGCAATTTGGAGGGCTTCTTTGCCACCCTGGGC
GGTGAAATTGCCCTGTGGTCCTTGGTGGTCCTGGCCATCGAGCGGTACGTGGTGGTGTGT
AAGCCCATGAGCAACTTCCGCTTCGGGGAGAACCATGCCATCATGGGCGTTGCCTTCACC
TGGGTCATGGCGCTGGCCTGCGCCGCACCCCCACTCGCCGGCTGGTCCAGGTACATCCCC
GAGGGCCTGCAGTGCTCGTGTGGAATCGACTACTACACGCTCAAGCCGGAGGTCAACAAC
GAGTCTTTTGTCATCTACATGTTCGTGGTCCACTTCACCATCCCCATGATTATCATCTTT
TTCTGCTATGGGCAGCTCGTCTTCACCGTCAAGGAGGCCGCTGCCCAGCAGCAGGAGTCA
GCCACCACACAGAAGGCAGAGAAGGAGGTCACCCGCATGGTCATCATCATGGTCATCGCT
TTCCTGATCTGCTGGGTGCCCTACGCCAGCGTGGCATTCTACATCTTCACCCACCAGGGC
TCCAACTTCGGTCCCATCTTCATGACCATCCCAGCGTTCTTTGCCAAGAGCGCCGCCATC
TACAACCCTGTCATCTATATCATGATGAACAAGCAGTTCCGGAACTGCATGCTCACCACC
ATCTGCTGCGGCAAGAACCCACTGGGTGACGATGAGGCCTCTGCTACCGTGTCCAAGACG
GAGACGAGCCAGGTGGCCCCGGCCTAA

Программа Пикотех показывает

8-14 - альфа-спираль.
21-26 - альфа-спираль.
28-31 - альфа-спираль.
35-44 - альфа-спираль.
46-70 - 310-альфа-спираль.
72-78 - альфа-спираль.
83-87 - альфа-спираль.
90-97 - альфа-спираль.
102-107 - альфа-спираль.
112-115 - альфа-спираль.
117-120 - альфа-спираль.
124-139 - альфа-спираль.
141-151 - альфа-спираль.
153-156 - альфа-спираль.
158-168 - альфа-спираль.
172-186 - альфа-спираль.
189-201 - альфа-спираль.
204-216 - альфа-спираль.
215-225 - программная 355-спираль.
224-233 - альфа-спираль.
235-239 - альфа-спираль.
238-248 - программная 255-спираль.
247-259 - альфа-спираль.
261-271 - альфа-спираль.
273-283 - альфа-спираль.
285-290 - альфа-спираль.
295-302 - альфа-спираль.
307-326 - альфа-спираль.
336-348 - альфа-спираль.

4.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/pdb/5XEZ

Structure of the full-length glucagon class B G-protein-coupled receptor

Zhang H, Qiao A, Yang D, Yang L, Dai A, de Graaf C, Reedtz-Runge S, Dharmarajan V, Zhang H, Han GW, Grant TD, Sierra RG, Weierstall U, Nelson G, Liu W, Wu Y, Ma L, Cai X, Lin G, Wu X, Geng Z, Dong Y, Song G, Griffin PR, Lau J, Cherezov V, Yang H, Hanson MA, Stevens RC, Zhao Q, Jiang H, Wang MW, Wu B

http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore … ureId=5XEZ
http://www.uniprot.org/uniprot/P47871
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/AAC … play=fasta

>ENA|AAC52063|AAC52063.1 Homo sapiens (human) glucagon receptor 
ATGCCCCCCTGCCAGCCACAGCGACCCCTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGGCCTGCCAG
CCACAGGTCCCCTCCGCTCAGGTGATGGACTTCCTGTTTGAGAAGTGGAAGCTCTACGGT
GACCAGTGTCACCACAACCTGAGCCTGCTGCCCCCTCCCACGGAGCTGGTGTGCAACAGA
ACCTTCGACAAGTATTCCTGCTGGCCGGACACCCCCGCCAATACCACGGCCAACATCTCC
TGCCCCTGGTACCTGCCTTGGCACCACAAAGTGCAACACCGCTTCGTGTTCAAGAGATGC
GGGCCCGACGGTCAGTGGGTGCGTGGACCCCGGGGGCAGCCTTGGCGTGATGCCTCCCAG
TGCCAGATGGATGGCGAGGAGATTGAGGTCCAGAAGGAGGTGGCCAAGATGTACAGCAGC
TTCCAGGTGATGTACACAGTGGGCTACAGCCTGTCCCTGGGGGCGCTGCTCCTCGCCTTG
GCCATCCTGGGGGGCCTCAGCAAGCTGCACTGCACCCGCAATGCCATCCACGCGAATCTG
TTTGCGTCCTTCGTGCTGAAAGCCAGCTCCGTGCTGGTCATTGATGGGCTGCTCAGGACC
CGCTACAGCCAGAAAATTGGCGACGACCTCAGTGTCAGCACCTGGCTCAGTGATGGAGCG
GTGGCTGGCTGCCGTGTGGCCGCGGTGTTCATGCAATATGGCATCGTGGCCAACTACTGC
TGGCTGCTGGTGGAGGGCCTGTACCTGCACAACCTGCTGGGCCTGGCCACCCTCCCCGAG
AGGAGCTTCTTCAGCCTCTACCTGGGCATCGGCTGGGGTGCCCCCATGCTGTTCGTCGTC
CCCTGGGCAGTGGTCAAGTGTCTGTTCGAGAACGTCCAGTGCTGGACCAGCAATGACAAC
ATGGGCTTCTGGTGGATCCTGCGGTTCCCCGTCTTCCTGGCCATCCTGATCAACTTCTTC
ATCTTCGTCCGCATCGTTCAGCTGCTCGTGGCCAAGCTGCGGGCACGGCAGATGCACCAC
ACAGACTACAAGTTCCGGCTGGCCAAGTCCACGCTGACCCTCATCCCTCTGCTGGGCGTC
CACGAAGTGGTCTTCGCCTTCGTGACGGACGAGCACGCCCAGGGCACCCTGCGCTCCGCC
AAGCTCTTCTTCGACCTCTTCCTCAGCTCCTTCCAGGGCCTGCTGGTGGCTGTCCTCTAC
TGCTTCCTCAACAAGGAGGTGCAGTCGGAGCTGCGGCGGCGTTGGCACCGCTGGCGCCTG
GGCAAAGTGCTATGGGAGGAGCGGAACACCAGCAACCACAGGGCCTCATCTTCGCCCGGC
CACGGCCCTCCCAGCAAGGAGCTGCAGTTTGGGAGGGGTGGTGGCAGCCAGGATTCATCT
GCGGAGACCCCCTTGGCTGGTGGCCTCCCTAGATTGGCTGAGAGCCCCTTCTGA

Программа Пикотех показывает

147-173 - наиболее протяженный участок альфа-310-спирали. 
Весь белок представлен преимущественно участками альфа-310-спиралей.

5.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17962520
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/ … ;uid=60314

High-resolution crystal structure of an engineered human beta2-adrenergic G protein-coupled receptor.

Cherezov V1, Rosenbaum DM, Hanson MA, Rasmussen SG, Thian FS, Kobilka TS, Choi HJ, Kuhn P, Weis WI, Kobilka BK, Stevens RC.

https://www.rcsb.org/pdb/explore/explor … ureId=2RH1

http://www.uniprot.org/uniprot/P00720
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/CAA28212

>ENA|CAA28212|CAA28212.1 Enterobacteria phage T4 hypothetical protein 
ATGAATATATTTGAAATGTTACGTATAGATGAACGTCTTAGACTTAAAATCTATAAAGAC
ACAGAAGGCTATTACACTATTGGCATCGGTCATTTGCTTACAAAAAGTCCATCACTTAAT
GCTGCTAAATCTGAATTAGATAAAGCTATTGGGCGTAATTGCAATGGTGTAATTACAAAA
GATGAGGCTGAAAAACTCTTTAATCAGGATGTTGATGCTGCTGTTCGCGGAATTCTGAGA
AATGCTAAATTAAAACCGGTTTATGATTCTCTTGATGCGGTTCGTCGCTGTGCATTGATT
AATATGGTTTTCCAAATGGGAGAAACCGGTGTGGCAGGATTTACTAACTCTTTACGTATG
CTTCAACAAAAACGCTGGGATGAAGCAGCAGTTAACTTAGCTAAAAGTATATGGTATAAT
CAAACACCTAATCGCGCAAAACGAGTCATTACAACGTTTAGAACTGGCACTTGGGACGCG
TATAAAAATCTATAA

Версия 2016 года -6var

Версия 2018 года - 7var

Темно-синим цветом показаны пи-спирали, бирюзовым - одиночные АО попи-коду.  Белок состоит преимущественно из пи-спиралей.

Этот пример демонстрирует, что РСА не от личает пи- от  310- спиралей.