Перевести страницу

Пикотехнология вкратце

Уточнение 2D структур некоторых белков, взятых из базы NCBI, методом Пикотех

*

*Посмотреть примеры пяти полных 2D Диаграмм Пикотех


https://img-fotki.yandex.ru/get/880375/249950893.0/0_16a3b7_7315a46a_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/893753/249950893.1/0_16aff1_b0049741_orig.png

Вторичная структура белка начинается с программной 35-спирали длиной 8 аминокислотных остатков. 8-ой остаток Ser является последним остатком программной 35-спирали и первым остатком пи-спирали, которая состоит из 4-х аминокислотных остатков. Далее идёт последовательность композиционных кодов 5233553, а за ней один виток альфа-спирали: 1111, образованный аминокислотными остатками LQST. Остатки SIP под номерами 38,39,40 образуют виток бета-спирали. Затем последовательность EEMKQI образует примерно половину витка программной 35-спирали. Остатки с 81 по 86 образуют гибридную альфа-310-спираль. Далее 87-90 идет пи-спираль. 94-98 - 310-спираль (полтора витка). 120-123 - один виток альфа-спирали. Участок 124-334 структурирован одиночными композиционными кодами всех типов. 335-341 - программная 355-спираль. 342-346 - программная 23-спираль. 346-351 - пи-спираль (примерно полтора витка). 360-363 - один виток 310-альфа-спирали. 378-383 - прямая альфа-спираль (полтора витка). 414-418 - альфа-310-спираль (примерно 1.3 витка).
431-435 - программная 23-спираль. 440-443 - гнутая метионином альфа-спираль (примерно 1.2 витка). 467-471 пи-спираль (примерно 1.2 витка). 469-480 - программная 3335-спираль.





https://img-fotki.yandex.ru/get/762837/249950893.1/0_16afcd_1b4a76df_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/509739/249950893.1/0_16b0a0_f8fd49ff_orig.png


147-173 - наиболее протяженный участок альфа-310-спирали. 
Весь белок представлен преимущественно участками альфа-310-спиралей.