Метилинозин срезает продольную диэфирную связь, оставляя триплет иРНК на антикодоновой петле тРНК. тРНК продолжает по инерции вращаться, пока третий нуклеотид кодона иРНК не встретит комплементарное основание на сайте рибосомы.
Третий нуклеотид триплета терминирует угол поворота тРНК в рибосоме. После этого аминокислота устанавливается в растующую белковую молекулу под нужным углом.
Пикотехнология вкратце
Подписаться на RSSОткрыт новый тип белковой структуры - метиониновая спираль
*
*
В отличие от альфа-спирали у метиониновой спирали более длинный шаг. Метиониновая спираль отличается от обычной альфа-спирали примерно как резьба с более крупным шагом от резьбы с менее крупным шагом
Вероятность замыкания дисульфидных мостиков в лизоцимах
*
*
|
Вероятность случайного совпадения результата работы геометрического алгоритма с экспериментальными данными для первых 6 участков не превышает 10^-84 |
|
|
Cys 95 - Cys 113 в человеческом лизоциме. |
1. 4^-18 6. 4^-23 |
 |
 |
|
|
|
Вероятность возврата пептидной цепи в обратном направлении
Реверсная структура, белка NP_060876.5 mucin-4 isoform a precursor [Homo sapiens]
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_060876.5?report=fasta.
Программная спираль совершает реверс в пространстве, возвращаясь относительно выбранного направления.
Вероятность случайного реверса такого размера белковой цепи составляет порядка 4^-900 = 10^-540
Вероятность случайных кодов сверх длинных спиралей
Q-спирали
Гексамер инсулина
Сопоставление модельного эксперимента Пикотех и натурного эксперимента методом ядерного магнитного резонанса и кругового дихроизма
Пикотехнологическая 3D модель антимикробного пептида PG-2 и экспериментальные данные по https://kpfu.ru/portal/docs/F485427986/Kolosova.magistr.pdf
Пикотехнология помогает визуально обнаружить активные центры белка
Рассмотрим более внимательно структуру конкурсного белка T0691:
Обратите внимание на расположение радикалов триптофана (квадратный 3х3) и тирозина (бензольное кольцо с группой OH) на переднем плане.
На заднем плане за радикалом триптофана тоже виден какой-то радикал. Всё это напоминает типовую структуру активного центра с резонансной системой.
Материал с форума лаборатории Наномир:
diprospan: да, и подтверждается тем, что совпадает дипольный момент:
Кушелев: Вы не могли бы дать более развёрнутый комментарий? Что за момент, с чем совпадает, откуда это видно?
В белке T0692 тоже обнаружился любопытный фрагмент, характерный для активных центров белка...
Наличие цикличного участка белка T0694, вероятно, можно проверить экспериментально.
Кушелев: И что с чем совпадает?
diprospan: активный центр белка пожалуй лучшее ваше определение в этом векторе.
Кушелев: Вы хотите сказать, что активный центр попадает в зону максимальной напряжённости электрического поля? Такое совпадение действительно вряд ли случайно...
Поле ориентирует некую полярную молекулу, после чего её обрабатывают на триптофановой наковальне в резонансном (?) режиме
Вторичная структура фактически замыкается. Изображение получено в браузере Avogadro
Любопытная структура белка T0697. Возможно, что спираль гнется на пролинах и образует некий реберный многогранник...
T0692, Trp467
Кушелев: Согласитесь, что таких совпадений не бывает...
