Перевести страницу

Пикотехнология вкратце

Пикотехнология помогает визуально обнаружить активные центры белка


Рассмотрим более внимательно структуру конкурсного белка T0691:



Обратите внимание на расположение радикалов триптофана (квадратный 3х3) и тирозина (бензольное кольцо с группой OH) на переднем плане.



На заднем плане за радикалом триптофана тоже виден какой-то радикал. Всё это напоминает типовую структуру активного центра с резонансной системой.



Материал с форума лаборатории Наномир: 


diprospan: да, и подтверждается тем, что совпадает дипольный момент:




Кушелев: Вы не могли бы дать более развёрнутый комментарий? Что за момент, с чем совпадает, откуда это видно? 



В белке T0692 тоже обнаружился любопытный фрагмент, характерный для активных центров белка... 



 Наличие цикличного участка белка T0694, вероятно, можно проверить экспериментально. 


Кушелев: И что с чем совпадает? 

diprospan: активный центр белка пожалуй лучшее ваше определение в этом векторе.

Кушелев: Вы хотите сказать, что активный центр попадает в зону максимальной напряжённости электрического поля? Такое совпадение действительно вряд ли случайно...


Поле ориентирует некую полярную молекулу, после чего её обрабатывают на триптофановой наковальне в резонансном (?) режиме



Вторичная структура фактически замыкается. Изображение получено в браузере Avogadro




Любопытная структура белка T0697. Возможно, что спираль гнется на пролинах и образует некий реберный многогранник... 



T0692, Trp467

Кушелев: Согласитесь, что таких совпадений не бывает... 



Источник